结论：公司在员工未转正的情况下私自扣工资，这一行为通常是不合法的。员工有权要求公司补发被扣的工资，并可根据具体情况考虑采取进一步的法律措施。
法律背景与解释：
试用期工资规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者在试用期的工资不得低于本单位相同岗位最低档工资或者劳动合同约定工资的百分之八十，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。这意味着，即使员工处于试用期，其工资也应受到法律保护，公司不得随意扣减。
公司扣工资的合法性：
- 公司扣工资通常需要有合法的理由，如员工违反公司规章制度、造成经济损失等，并且需要按照法定程序进行。在员工未转正的情况下，如果公司没有合法理由且未遵循法定程序，私自扣工资则构成违法行为。
员工权益保护：
- 员工在遇到公司私自扣工资的情况时，有权要求公司补发被扣的工资。如果公司拒绝补发，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
法律建议：
与公司沟通：
- 首先，建议员工与公司进行沟通，了解扣工资的具体原因，并要求公司出示相关的规章制度或合同条款作为依据。如果公司无法提供合法依据，员工可以明确表示反对并要求补发工资。
收集证据：
- 在沟通过程中，员工应注意收集相关证据，如工资条、银行转账记录、与公司沟通的聊天记录或录音等，以备后续维权之需。
寻求法律帮助：
- 如果公司拒绝补发工资或沟通无果，员工可以寻求法律帮助。可以向当地劳动监察部门投诉，或者咨询专业律师，通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果公司被认定存在私自扣工资的违法行为，可能需要承担补发工资、支付赔偿金等法律责任。同时，公司的违法行为还可能受到劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
举例说明：
- 假设员工小张在试用期内的工资为每月5000元，但公司未经合法程序私自扣除了1000元工资。小张在了解相关法律规定后，与公司沟通无果，于是向当地劳动监察部门投诉。经过调查，劳动监察部门认定公司存在违法行为，责令公司补发小张被扣的1000元工资，并可能对公司处以罚款等处罚。
综上所述，公司在员工未转正的情况下私自扣工资是不合法的行为。员工应了解自己的权益和法律保护途径，积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。