公司私自扣除员工工资是违法的。

公司或用人单位应当按时足额支付劳动者的工资，不得克扣或者无故拖欠。这是《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规明确规定的。具体来说：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
   • 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也规定：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”

2. 员工维权途径：

   • 内部沟通：首先尝试与公司领导或人力资源部门沟通，了解扣工资的具体原因，并要求给出合理解释和依据。
   • 外部投诉：若内部沟通无果，可向当地劳动监察部门投诉，提交相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等），由劳动监察部门介入调查并处理。
   • 法律仲裁与诉讼：若对劳动监察部门的处理结果不满意，或公司拒绝改正，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

3. 特殊情况说明：

   • 虽然公司一般不得随意克扣员工工资，但在特定情况下（如员工因违反公司管理制度给公司造成经济损失时），公司有权依据相关法律规定扣发工资。但这种扣除必须符合法定条件，如扣除金额不能超过员工当月工资的20%，且扣除后的工资不能低于当地最低工资标准。

综上所述，公司私自扣除员工工资是违法的，员工应勇于运用法律武器维护自己的合法权益。若遇到此类情况，可先尝试与公司沟通解决，若无果则可通过投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的权益。