结论：请假了但正常打卡却被按旷工扣满勤，这一做法是否合理，需分情况讨论，一般情况下不合理，但若请假未获批准或存在其他特殊情况则可能合理。以下是对此问题的详细分析：
一、请假已获批准的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工享有休息休假的权利，且请假流程通常需经过公司审批。若员工已按照公司规定流程请假并获得批准，那么在此期间员工应被视为正常休假，不应被扣减满勤或工资。
具体分析：
- 如果员工已经按照公司规定提交了请假申请，并且得到了上级或人力资源部门的批准，那么员工在请假期间的行为（包括打卡）应被视为正常休假的一部分。公司无权因员工请假而扣减其满勤或工资，除非请假期间员工确实存在违反公司规定或法律法规的行为。
- 在此情况下，若公司仍按旷工扣满勤，员工有权向公司提出异议，并要求公司纠正错误做法。若公司拒绝纠正，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
二、请假未获批准的情况
法律背景：
- 若员工请假未获批准而擅自离岗，公司有权按照规章制度对其进行处理，包括扣减满勤、工资或进行其他纪律处分。
具体分析：
- 如果员工未按照公司规定流程请假或请假未获批准而擅自离岗，那么员工的行为可能构成旷工。在此情况下，公司有权按照规章制度对员工进行处理，包括扣减满勤或工资。
- 但需要注意的是，公司在处理此类情况时，应确保规章制度的合法性和合理性，并遵循公平、公正、公开的原则。若公司规章制度存在违法或不合理之处，员工有权提出异议并要求公司进行修正。
三、其他特殊情况
打卡异常：
- 如果员工请假期间打卡出现异常（如误打卡、忘记打卡等），且能够提供合理证明（如请假条、医院证明等），那么公司应考虑实际情况，避免盲目扣减满勤或工资。
公司规章制度：
- 公司在制定规章制度时，应明确请假、旷工、满勤等相关概念和处理方式，并确保规章制度的合法性和合理性。若公司规章制度存在模糊或不明确之处，可能导致处理结果引发争议。
四、建议与措施
对于员工：
- 在请假前，应仔细了解公司规章制度，确保请假流程符合规定。
- 若请假期间打卡出现异常，应及时与公司沟通并提供合理证明。
- 若公司扣减满勤或工资存在争议，可以向公司提出异议并要求纠正；若公司拒绝纠正，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于公司：
- 应制定合法、合理的规章制度，并明确请假、旷工、满勤等相关概念和处理方式。
- 在处理员工请假和旷工问题时，应遵循公平、公正、公开的原则，确保处理结果合法、合理。
- 应加强与员工的沟通，及时解答员工疑问，避免因信息不对称而引发争议。
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