公司只发现金不打卡的行为，可能涉及多个方面的法律问题，具体分析如下：

1. 劳动法合规性角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当建立劳动考勤制度，书面记录劳动者的出勤情况，每月与劳动者核对并由劳动者签字。打卡是常见的考勤方式之一，它有助于确保考勤记录的准确性和公正性。
   • 如果公司只发现金而不打卡，且没有其他有效的考勤记录方式，这可能违反了劳动法的相关规定，因为缺乏准确的考勤记录可能导致员工权益受损，如加班费计算不准确、工资支付不透明等。

2. 税务合规性角度：

   • 从税务角度来看，公司支付工资应当通过银行转账等合法方式进行，并依法代扣代缴个人所得税。现金支付虽然不直接违法，但如果公司未依法进行税务申报和缴纳，就可能构成偷税漏税行为。
   • 此外，如果公司长期以现金形式支付工资且不打卡，可能引发税务机关的关注，因为这种支付方式可能更容易被用于隐瞒收入、逃避税务监管。

3. 员工权益保护角度：

   • 打卡制度有助于保护员工的合法权益，如确保加班费、带薪休假等福利的准确计算。如果公司不打卡，员工可能难以证明自己的出勤情况，从而在维权时处于不利地位。
   • 同时，现金支付也可能增加员工的风险，如丢失、被盗等，且难以追溯和证明。

4. 公司管理角度：

   • 从公司管理的角度来看，打卡制度有助于提升公司的管理效率和规范化程度。如果公司不打卡，可能导致管理混乱、效率低下等问题。
   • 此外，现金支付也可能增加公司的财务管理成本和风险，如现金管理、安全保管等问题。

针对以上分析，我给出以下建议：

• 公司应建立完善的考勤制度：包括打卡、签到或其他有效的考勤记录方式，并确保考勤记录的准确性和公正性。
• 公司应依法支付工资并代扣代缴个人所得税：通过银行转账等合法方式进行工资支付，并依法进行税务申报和缴纳。
• 员工应保留好自己的出勤和工资支付记录：以备在维权时使用。如果公司存在违法行为，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

如果公司只发现金不打卡的行为已经引发了法律纠纷或员工权益受损的情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。作为姚海珍律师，我擅长处理公司法务和劳动工伤领域的问题，如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。