结论：劳动合同中约定未完成任务扣款是否合法，需分情况讨论，若扣款实质为罚款且无法律依据，则不合法；若扣款属于薪酬考核制度的一部分且合理合法，则可能合法。以下从不同角度详细分析：
一、从罚款的合法性角度分析
罚款的公权力属性：
- 罚款通常被视为公权力运用的范畴，根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。用人单位作为平等主体之间的民事关系一方，无权对劳动者实施罚款。
用人单位对劳动者的管理权限：
- 虽然用人单位有权对劳动者进行管理，但这种管理应当限于合理的范围内，且不得违反法律法规的规定。用人单位对劳动者未完成任务进行扣款，若实质上构成罚款，则缺乏法律依据，因此不合法。
二、从薪酬考核制度的角度分析
薪酬考核制度的合法性：
- 用人单位可以制定薪酬考核制度，对劳动者的工作表现进行评估，并根据评估结果调整劳动者的薪酬。这种调整应当基于合理的考核标准，且不得违反法律法规的强制性规定。
扣款作为薪酬考核的一部分：
- 如果劳动合同中的扣款条款是作为薪酬考核制度的一部分，且该制度合理合法，扣款金额与劳动者的未完成任务程度相匹配，且未超过法定限额，那么这种扣款可能是合法的。但需要注意的是，即使扣款合法，用人单位也应当确保扣款过程透明、公正，避免引发争议。
三、从具体法律规定和地区性法规的角度分析
《广东省劳动保障监察条例》的相关规定：
- 根据《广东省劳动保障监察条例》第五十一条，用人单位的规章制度规定了罚款内容，或者其扣减工资的规定没有法律、法规依据的，由人力资源社会保障行政部门责令改正，给予警告。用人单位对劳动者实施罚款或者没有法律、法规依据扣减劳动者工资的，由人力资源社会保障行政部门责令限期改正；逾期未改正的，按照被罚款或者扣减工资的人数每人二千元以上五千元以下的标准处以罚款。这一规定明确指出了用人单位无权对劳动者实施罚款，且扣减工资需有法律、法规依据。
其他地区性法规的类似规定：
- 虽然不同地区的具体法规可能有所不同，但大多数地区都倾向于保护劳动者的权益，限制用人单位对劳动者的处罚权限。因此，在制定劳动合同中的扣款条款时，用人单位应当充分考虑当地法规的要求。
四、建议与风险提示
对用人单位的建议：
- 用人单位在制定劳动合同和薪酬考核制度时，应当确保条款的合法性和合理性。避免使用“罚款”等可能引发争议的词汇，而采用“减扣工资报酬”等更中性的表述。同时，应当确保扣款过程透明、公正，且扣款金额不得超过法定限额。
对劳动者的风险提示：
- 劳动者在签订劳动合同时，应当仔细阅读合同条款，特别是关于薪酬和扣款的条款。如果发现合同中存在不合理的扣款条款，应当及时与用人单位协商修改或拒绝签订。在劳动过程中，如果遭遇用人单位的不合理扣款，劳动者有权向当地人力资源社会保障行政部门投诉或申请劳动仲裁。
总结：劳动合同中约定未完成任务扣款是否合法，需根据具体情况判断。用人单位应当确保扣款条款的合法性和合理性，避免侵犯劳动者的权益。劳动者在签订劳动合同时应当仔细阅读合同条款，并在遭遇不合理扣款时及时维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。