结论：在工伤医疗期内，用人单位要求员工签署自离终止劳动关系确定书的行为，一般是不合法的。以下从多个角度进行分析：

一、工伤医疗期的法律保护

根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，在工伤医疗期内，员工享有法律上的特殊保护，用人单位不得随意解除或终止与员工的劳动关系。

二、自离终止劳动关系的法律后果

自离，即员工主动提出解除劳动关系。然而，在工伤医疗期内，员工往往因伤势未愈而无法正常工作，此时要求员工签署自离终止劳动关系确定书，实际上剥夺了员工在工伤医疗期内应享有的法律保护和福利待遇。这种行为不仅违反了《工伤保险条例》的规定，也可能对员工的合法权益造成损害。

三、用人单位的合法解除或终止情形

根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在特定情形下可以解除或终止与员工的劳动关系，如员工严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等。但这些情形并不包括员工在工伤医疗期内的情况。因此，在工伤医疗期内，用人单位要求员工签署自离终止劳动关系确定书，并不符合法律规定的解除或终止劳动关系的情形。

四、员工的应对策略

如果员工在工伤医疗期内被用人单位要求签署自离终止劳动关系确定书，员工可以采取以下措施：

1. 拒绝签署：员工有权拒绝签署任何违反法律规定的文件，包括自离终止劳动关系确定书。
2. 向劳动监察部门投诉：员工可以向当地劳动监察部门投诉用人单位的违法行为，要求劳动监察部门进行调查并处理。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果员工的合法权益受到侵害，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求用人单位承担相应的法律责任。

五、特殊情况下的处理

当然，也存在一些特殊情况，如员工在工伤医疗期内主动提出离职，并经过用人单位同意的。但这种情况与用人单位要求员工签署自离终止劳动关系确定书是不同的。在员工主动提出离职的情况下，双方可以协商一致后办理离职手续，但这并不意味着用人单位可以在工伤医疗期内强制要求员工离职。

综上所述，在工伤医疗期内，用人单位要求员工签署自离终止劳动关系确定书的行为一般是不合法的。员工有权拒绝签署，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁、提起诉讼来维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。