结论：事业编试用期员工因先天性心脏病请假，是否会被辞退不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、医疗期保护角度

1. 医疗期规定：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应给予一定期限的医疗期。医疗期的具体长度根据员工实际工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3个月到24个月不等。对于事业编员工，虽然该规定主要针对企业职工，但事业单位在处理类似情况时，通常会参照执行或依据内部规章制度给予相应医疗期。
2. 医疗期内辞退限制：在医疗期内，除非员工存在严重违反用人单位规章制度等法定过错情形，否则用人单位不得解除劳动合同。因此，如果事业编试用期员工因先天性心脏病请假，且处于医疗期内，单位一般不能仅因请假就将其辞退。

二、试用期考核角度

1. 试用期考核标准：试用期是用人单位和员工相互了解、选择的过程。用人单位通常会设定一定的考核标准，对员工的工作能力、工作态度等进行评估。如果员工因病请假，导致无法正常参加考核或无法达到考核标准，用人单位可能会根据考核结果决定是否继续录用。
2. 合理调整考核方式：然而，对于因病请假的员工，用人单位应合理调整考核方式，不能仅因请假就否定其工作能力或态度。例如，可以延长考核期限、采用其他考核方式等，以确保考核结果的公平性和合理性。如果用人单位未合理调整考核方式，仅因请假就辞退员工，可能构成违法解除劳动合同。

三、特殊保护角度

1. 残疾人保护：如果先天性心脏病构成残疾，员工还可能受到《残疾人保障法》等法律法规的特殊保护。根据这些法律法规，用人单位不得歧视残疾人，应为其提供适当的就业条件和岗位，并保障其合法权益。因此，如果事业编试用期员工因先天性心脏病构成残疾，单位在辞退时需更加谨慎，确保不违反相关法律法规。
2. 内部规章制度：事业单位通常会有自己的内部规章制度，对员工的请假、考核、辞退等事项进行具体规定。在处理类似情况时，单位应首先查阅并遵守内部规章制度。如果规章制度中未明确规定或规定与法律法规相冲突，应以法律法规为准。

法律建议

1. 保留证据：如果事业编试用期员工因先天性心脏病请假，建议保留好相关医疗证明、请假记录等证据，以备不时之需。
2. 沟通协商：在请假期间或请假结束后，建议与单位进行积极沟通协商，说明自己的身体状况和请假原因，争取单位的理解和支持。
3. 寻求法律援助：如果单位违反相关法律法规或内部规章制度，仅因请假就辞退员工，员工可以寻求法律援助或向劳动争议调解仲裁机构申请调解仲裁，维护自己的合法权益。

总结：事业编试用期员工因先天性心脏病请假是否会被辞退，需结合医疗期保护、试用期考核、特殊保护以及内部规章制度等多个角度进行综合判断。在处理类似情况时，建议员工保留好相关证据、积极沟通协商，并在必要时寻求法律援助。如有具体法律问题，可以直接向我咨询。