员工上班被店长打，属于遭受职场暴力及人身侵害，员工有权通过法律途径维护自身权益，具体处理方式如下：

1. 立即保护自身安全并报警
   无论伤势轻重，第一时间确保自身安全，避免冲突升级。若店长仍在现场或可能继续施暴，应迅速离开危险区域，并立即拨打110报警。警方介入后，会依法对打人行为进行调查，并根据伤情鉴定结果（如轻微伤、轻伤等）决定是否追究店长行政或刑事责任。根据《治安管理处罚法》第四十三条，殴打他人的，可处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款；若构成轻伤及以上，则可能触犯《刑法》第二百三十四条故意伤害罪，面临三年以下有期徒刑、拘役或管制。

2. 保留证据，为后续维权做准备
   证据是维权的关键，需尽可能收集以下材料：

   • 现场证据：如监控录像、录音、目击者联系方式等，证明店长施暴的事实；
     
   • 医疗证据：及时就医并保存病历、诊断证明、医疗费票据等，证明伤情及治疗费用；
     
   • 沟通记录：如与店长或公司的聊天记录、邮件等，证明事件背景或公司态度；
     
   • 其他证据：如被打后的照片、视频等，直观展示伤情。
     

3. 向公司主张权利，要求处理店长并赔偿
   根据《劳动合同法》第三十八条，若公司未提供劳动保护或劳动条件（包括职场安全），员工可解除劳动合同并要求经济补偿。同时，公司作为用人单位，有义务保障员工人身安全，若未尽到管理职责导致员工被打，需承担相应责任。员工可向公司人力资源部门或上级领导反映情况，要求：

   • 对店长进行纪律处分（如警告、停职、解雇等）；
     
   • 承担医疗费、误工费等合理损失；
     
   • 若公司拒绝处理，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
     

4. 申请工伤认定（若符合条件）
   根据《工伤保险条例》第十四条，在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的，应认定为工伤。员工可向当地社保部门申请工伤认定，若认定成功，可享受工伤保险待遇，包括医疗费、伤残补助金等。需注意，工伤认定需以“因履行工作职责”为前提，若打人行为与工作无关（如私人恩怨），则可能不构成工伤，但仍可主张人身损害赔偿。

5. 提起民事诉讼，主张人身损害赔偿
   若店长行为构成侵权，员工可根据《民法典》第一千一百七十九条，向法院提起民事诉讼，要求店长赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。若造成残疾，还可主张残疾赔偿金、辅助器具费等；若造成死亡，家属可主张丧葬费、死亡赔偿金等。

温馨提示：职场暴力不可容忍，员工在维护自身权益时，需保持冷静，依法行事。若遇到公司推诿或店长威胁，可寻求警方、劳动部门或工会帮助。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。