二倍工资差额通常不包含加班费。这一结论主要基于二倍工资的性质、立法目的以及司法实践中的普遍做法。以下是对这一问题的详细分析：

一、二倍工资的性质与立法目的

二倍工资是用人单位因违反法律规定（如未签订书面劳动合同）而需承担的额外经济责任，它并非劳动者的常规劳动报酬，而是一种惩罚性赔偿。立法设置二倍工资的目的在于促使用人单位及时与劳动者签订书面劳动合同，以规范劳动用工关系，保障劳动者的合法权益，减少因劳动关系不明确而产生的纠纷。因此，二倍工资的计算基数应当与劳动者正常工作时间内的工资相对应，而不应包括加班工资等额外收入。

二、司法实践中的普遍做法

在司法实践中，各地法院在处理因未签订劳动合同而引发的二倍工资争议时，普遍遵循将加班工资排除在外的原则。例如，最高人民法院民事审判第一庭在相关著作中明确指出，二倍工资差额的计算基数为正常工作时间工资。北京市高级人民法院、北京市劳动争议仲裁委员会也在相关会议纪要中规定，计算未签订劳动合同二倍工资的基数应按照劳动者正常工作时间应得的工资计算，不包括加班工资等。这些规定和做法均体现了司法实践对二倍工资性质的准确理解和把握。

三、具体案例与法律分析

以一个具体案例为例，假设劳动者小张在某公司工作，公司未与其签订书面劳动合同，且小张存在加班情况。当小张主张二倍工资时，其计算基数应为小张正常工作时间内的工资，而不应包括加班工资。这是因为加班工资是劳动者在超出法定工作时间外提供劳动所获得的报酬，属于特殊情况下支付的工资，不应纳入二倍工资的计算范畴。

四、劳动者主张二倍工资时的注意事项

1. 计算基数：二倍工资的计算基数应为劳动者正常工作时间内的工资，不包括加班工资、奖金、津贴等其他形式的收入。
2. 时间范围：二倍工资的支付时间范围为自用工之日起超过一个月不满一年的期间。若用人单位在此之后仍未与劳动者签订劳动合同，则应承担其他相应的法律责任。
3. 证据收集：劳动者在主张二倍工资时，应尽可能收集并提供能够证明其与用人单位存在劳动关系且用人单位未与其签订劳动合同的证据，如工作记录、考勤记录、银行流水等。

五、地区差异与实际操作

尽管总体原则明确，但在司法实践中，不同地区可能会根据当地的具体法律法规和实际情况进行细微调整。因此，在实际操作中，如果遇到关于二倍工资计算的具体问题，建议结合当地的法律法规和具体案例进行综合判断和处理。

综上所述，二倍工资差额通常不包含加班费，这是由二倍工资的性质和立法目的所决定的，也是司法实践中的普遍做法。劳动者在主张二倍工资时，应注意计算基数、时间范围和证据收集等问题，以确保自身权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。