工厂对辞职员工不一定会扣工资，这主要取决于辞职的具体情形以及相关法律法规和劳动合同的约定。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法辞职且无过错情形下的工资支付
正常辞职流程：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期提前三日），可以解除劳动合同。在这种情况下，工厂应当按照劳动合同的约定，在解除劳动合同时一次付清劳动者工资，不得无故克扣或拖欠。
- 例如，员工月工资为6000元，按照正常辞职流程提前通知了工厂，那么在离职时，工厂应全额支付该员工当月的工资6000元。
经济补偿金支付：
- 如果工厂因自身原因（如经营不善、裁员等）合法辞退员工，除了支付正常工资外，还需根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付经济补偿金。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 例如，员工在工厂工作了3年，月工资为5000元，那么工厂在辞退该员工时，除了支付当月工资外，还需支付3个月工资作为经济补偿金，即15000元。
二、员工存在过错情形下的工资扣除
给工厂造成经济损失：
- 若员工因故意或重大过失给工厂造成经济损失，工厂可按劳动合同约定或相关法律规定要求员工赔偿。赔偿额可从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 例如，员工因操作不当导致工厂设备损坏，维修费用为2000元。该员工月工资为4000元，那么工厂每月最多可从其工资中扣除800元（4000元的20%）作为赔偿，直至扣完2000元为止，且扣除后该员工每月剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
违反培训服务期协议或竞业限制协议：
- 如员工违反了培训服务期协议或竞业限制协议，工厂可依据协议约定要求员工支付违约金。违约金数额需合理且符合法律规定，可从员工工资中扣除，但同样需遵守每月扣除部分不得超过当月工资20%以及扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准的规定。
- 例如，员工与工厂签订了培训服务期协议，约定服务期为3年，工厂为员工提供了价值3万元的培训。员工在服务期未满时辞职，违反了协议约定。根据协议，员工需支付违约金，假设违约金为剩余服务期对应的培训费用分摊部分（即1万元，按剩余2年服务期分摊计算）。若员工月工资为5000元，工厂每月最多可从其工资中扣除1000元（5000元的20%）作为违约金，直至扣完1万元为止。
三、工厂违法辞退情形下的工资支付
- 如果工厂无合法理由辞退员工，属于违法解除劳动合同。根据《中华人民共和国劳动法》第九十一条规定，工厂不仅不能扣钱，还需向员工支付经济补偿金，拒不支付的由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。赔偿金标准为经济补偿标准的二倍。
- 例如，员工在工厂工作了2年，月工资为4000元，工厂违法辞退了该员工。那么工厂除了需支付当月工资外，还需支付2个月工资作为经济补偿金（即8000元），若拒不支付，劳动行政部门可责令其支付，并可责令支付赔偿金，赔偿金为经济补偿标准的二倍，即16000元。
四、实践建议与权益保护
- 确保工资正常结算：劳动者在被辞职时，应确保自己的工资得到正常结算，并关注是否有权获得经济补偿金。
- 了解赔偿与扣款情况：对于可能涉及的赔偿或扣款，劳动者应了解具体情况，确保工厂行为符合法律规定。
- 维护合法权益：若工厂在辞职过程中存在违法行为，如无故扣减工资或拒绝支付经济补偿金，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，工厂对辞职员工是否扣工资不能一概而论，需根据具体情况判断。如果你在辞职过程中遇到工资被扣或相关权益受到侵害的情况，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。