结论前置：年休假已发通知让员工休，但员工没选择休息，是否算员工主动放弃假期，需分情况讨论，不能一概而论。
详细分析：
公司通知的具体内容与形式：
- 如果公司发出的通知明确告知员工在特定时间内必须休完年休假，且未提供其他选择（如加班或调休），而员工未在此期间休假，这通常不能直接视为员工主动放弃假期。因为公司有义务确保员工享受年休假，若通知方式或内容存在瑕疵，可能影响对员工“放弃”行为的认定。
- 如果公司通知中明确询问员工是否愿意放弃年休假，并得到了员工的明确书面或口头确认，那么这种情况下可以视为员工主动放弃了假期。
员工未休假的原因：
- 如果员工因个人原因（如家庭事务、个人健康等）无法在规定时间内休假，且已向公司说明情况并寻求延期或调休，那么这不应被视为员工主动放弃假期。公司应根据实际情况给予合理安排。
- 如果员工无正当理由拒绝休假，且未与公司进行任何沟通或协商，那么在一定程度上，可以认为员工有主动放弃假期的倾向。但即便如此，公司也应谨慎处理，避免单方面认定员工放弃假期而引发劳动纠纷。
公司政策与法律法规的遵循：
- 根据《职工带薪年休假条例》等相关法律法规，公司有义务保障员工享受年休假。如果公司未按照规定安排员工休假，或者未支付未休假工资报酬，那么公司可能面临法律责任。
- 在处理员工未休假的问题时，公司应遵循公平、公正、合理的原则，与员工进行充分沟通，并尽量达成双方都能接受的解决方案。
法律建议：
- 对于公司而言，在发出年休假通知时，应明确告知员工休假的时间、方式以及未休假的后果。同时，应建立完善的休假管理制度，确保员工能够顺利享受年休假。
- 对于员工而言，如果因特殊原因无法在规定时间内休假，应及时与公司沟通并寻求解决方案。如果公司无正当理由拒绝安排休假或支付未休假工资报酬，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
可能后果：
- 如果公司被认定未按照规定安排员工休假或未支付未休假工资报酬，可能面临劳动监察部门的处罚或员工的法律诉讼。
- 如果员工被认定无正当理由拒绝休假且未与公司沟通，可能影响其与公司之间的关系，甚至面临公司的纪律处分。但这种情况下的处分也应遵循法律法规和公司规章制度的规定。
总之，在处理年休假问题时，公司和员工都应遵循法律法规的规定和公司的规章制度，通过充分沟通达成双方都能接受的解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。