不签劳动合同的双倍工资赔偿与保险扣除部分无直接关联，双倍工资赔偿是基于未签书面劳动合同这一违法行为，按照劳动者应得工资来计算，并非只加入被公司扣除的部分。以下为你详细分析：

从双倍工资赔偿的计算依据来看

根据《劳动合同法》第八十二条规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这里计算双倍工资的基数是劳动者应得的工资，应得工资是指劳动者在提供正常劳动的情况下，用人单位应当支付给劳动者的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入，并不局限于被公司扣除部分之后剩余的工资。

例如，劳动者每月应得工资为8000元，其中公司因某些原因扣除500元，实际发放7500元。在计算双倍工资赔偿时，是以8000元为基数进行计算，而不是以7500元为基数。

从保险扣除的性质来看

公司扣除的部分通常是用于为劳动者缴纳社会保险等法定费用。社会保险是国家强制要求用人单位和劳动者参加的，这部分费用的扣除是基于法律规定，目的是保障劳动者在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。保险扣除与双倍工资赔偿是两个不同的法律概念和法律关系，不能将保险扣除部分与双倍工资赔偿的计算混为一谈。

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