结论前置：农民工每月只发生活费是否合法，需根据具体情况判断。若用人单位与农民工协商一致，且能保障农民工基本生活并按时足额支付剩余工资，则可能合法；若未经协商或无法保障农民工权益，则不合法。
详细分析：
协商一致且保障权益的情况：
- 法律依据：根据《劳动法》及相关规定，用人单位与劳动者应当遵循平等自愿、协商一致的原则签订劳动合同，并约定工资支付方式。若双方协商一致，用人单位可以采取分阶段支付工资的方式，包括每月先支付生活费，剩余部分在特定时间（如工程结束、年底等）一次性或分期支付。
- 实际操作：在这种情况下，用人单位需确保农民工的基本生活不受影响，且剩余工资能够按时足额支付。若用人单位能够做到这一点，并提前与农民工明确约定，则每月只发生活费的做法是合法的。
未经协商或无法保障权益的情况：
- 法律依据：同样根据《劳动法》及相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。若用人单位未经与农民工协商，擅自决定每月只发生活费，且无法保障农民工的基本生活或剩余工资的按时足额支付，则这种做法是不合法的。
- 法律后果：农民工有权向劳动监察部门投诉，要求用人单位支付拖欠的工资，并可能获得相应的赔偿。同时，用人单位还可能面临行政处罚，如罚款、责令改正等。
建议与提醒：
- 农民工：在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付方式的约定。若用人单位提出每月只发生活费，应要求用人单位明确剩余工资的支付时间和方式，并确保自己的基本生活不受影响。若用人单位无法保障这些权益，农民工有权拒绝签订这样的合同，并向劳动监察部门投诉。
- 用人单位：应遵守相关法律法规，与农民工协商一致后确定工资支付方式。若采取分阶段支付工资的方式，应确保农民工的基本生活不受影响，并按时足额支付剩余工资。否则，将面临法律责任和声誉损失。
特殊情况说明：
- 在某些特殊情况下，如工程周期长、资金周转困难等，用人单位可能确实需要采取分阶段支付工资的方式。但这种情况下，用人单位应提前与农民工协商，并制定合理的支付计划，确保农民工的权益不受损害。同时，用人单位还应积极寻求政府或相关部门的支持和帮助，以缓解资金压力。
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