国企合同工在入职或工作过程中，国企有可能会查案底，但具体是否会查以及查案底的目的和范围，会因国企的具体规定和岗位需求而有所不同。以下从几个角度进行详细分析：
入职前的背景调查：
- 国企在招聘合同工时，为了确保招聘到的人员符合岗位要求，且具备良好的品行和职业道德，可能会进行背景调查。这种调查可能包括查询应聘者的犯罪记录，即案底。
- 特别是对于一些涉及国家安全、机密或重要财务等敏感岗位，国企更可能会严格审查应聘者的背景，以确保没有潜在的安全风险。
工作过程中的定期审查：
- 在某些情况下，国企可能会对在职员工进行定期的背景审查或安全审查，以确保员工在工作期间没有违法犯罪行为。
- 这种审查可能是在员工晋升、调岗或涉及重要项目时进行，以评估员工的可靠性和忠诚度。
法律法规的遵循：
- 国企作为国家的企业，必须遵循国家的法律法规。如果相关法律法规要求国企在招聘或管理员工时查询犯罪记录，那么国企就会依法进行查询。
- 例如，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律规定，对于某些特定岗位或特定情况，用人单位有权查询应聘者的犯罪记录。
国企内部规定：
- 除了法律法规的要求外，国企还可能根据自身的内部规定和岗位需求，决定是否查询员工的案底。
- 这些内部规定可能因国企的性质、规模、行业特点等因素而有所不同。
法律建议：
- 如果您是国企合同工或即将成为国企合同工，且担心自己的案底会影响工作，建议您在入职前主动向国企说明情况，并咨询相关法律法规和国企的内部规定。
- 如果国企在查询您的案底后，因您的犯罪记录而拒绝录用或解除劳动合同，您有权了解具体原因，并可以根据相关法律法规维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果您的案底与国企的岗位要求或内部规定相冲突，国企可能会拒绝录用您或解除与您的劳动合同。
- 但如果您已经改过自新，且案底与当前工作无直接关联，国企在综合考虑后，也可能会给予您工作机会。
总之，国企合同工是否会查案底，取决于多种因素。如果您有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。