针对您提出的“把活包给个人，包活的人跑了，所有农民工工资全是我们公司代付的，怎么起诉他”的问题，以下是我从法律角度给出的详细分析和建议：

一、明确法律关系与责任主体

首先，需要明确的是，您公司作为发包方，与包工头之间形成了承包合同关系。而包工头与农民工之间则形成了雇佣关系。当包工头逃跑，导致农民工工资无法按时支付时，从法律上讲，包工头作为雇主，应当承担支付农民工工资的责任。然而，在实际操作中，由于包工头可能缺乏足够的财产来支付工资，因此您公司作为发包方，在代付工资后，有权向包工头追偿。

二、起诉前的准备

1. 收集证据：

   • 承包合同：证明您公司与包工头之间的承包关系。
   • 工资发放记录：证明您公司已经代付了农民工的工资。
   • 包工头逃跑的证据：如包工头失联的证明、无法联系到包工头的记录等。
   • 农民工的证言或书面材料：证明他们确实为包工头工作，且工资未得到支付。

2. 确定被告：

   • 明确包工头的身份信息，包括姓名、身份证号码、联系方式等，以便在起诉时准确指定被告。

三、起诉途径与流程

1. 向劳动监察部门投诉：

   • 虽然这主要是针对用人单位拖欠工资的行为，但您可以尝试向劳动监察部门说明情况，看是否能获得一定的帮助或指导。不过，由于包工头并非用人单位，此途径可能效果有限。

2. 申请劳动仲裁（此途径可能不直接适用，但可作为参考）：

   • 通常情况下，劳动仲裁是处理用人单位与劳动者之间劳动争议的途径。但在此情况下，由于包工头并非用人单位，直接申请劳动仲裁可能不适用。不过，您可以咨询当地劳动仲裁机构，看是否有其他相关的仲裁程序或建议。

3. 向人民法院提起诉讼：

   • 起诉状：准备一份详细的起诉状，说明您公司的诉求、事实与理由，并附上相关证据。
   • 提交法院：将起诉状及相关证据提交至有管辖权的人民法院。通常，这可以是包工头户籍所在地或经常居住地的基层人民法院。
   • 参与诉讼：在法院受理案件后，积极参与诉讼过程，包括出庭、举证、质证等。
   • 申请支付令：如果法院认为符合条件，可以发布支付令，要求包工头在规定期限内支付您公司代付的工资。如果包工头在规定期间内不提出异议又不履行支付令，您公司可以向人民法院申请执行。

四、法律建议与风险提示

1. 及时起诉：由于包工头可能随时转移财产或隐匿行踪，建议您尽快收集证据并起诉，以增加追偿的成功率。

2. 考虑财产保全：在起诉前或起诉过程中，您可以考虑向法院申请财产保全，冻结包工头的银行账户或其他财产，以确保判决后能够顺利执行。

3. 咨询专业律师：虽然我作为包燕律师已经给出了上述建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在起诉前或诉讼过程中，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律指导和帮助。

4. 风险提示：起诉包工头可能面临一定的风险，如包工头无财产可供执行、执行难度大等。因此，在起诉前需要充分评估风险并做好相应的准备。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。