核心前提：厂房作为不动产，其所有权或使用权受法律保护。若厂房被他人非法侵占，权利人可通过法律途径维护权益。
结论前置：针对厂房被侵占问题，可按以下步骤处理：

1. 固定证据，明确侵占事实

   • 收集侵占行为的证据，包括但不限于：
     
     • 现场照片、视频（显示侵占方占用厂房的状态）；
       
     • 书面通知（如要求侵占方搬离的函件，需留存送达凭证）；
       
     • 证人证言（如周边人员、物业管理人员等）；
       
     • 权属证明（如房产证、土地使用权证、租赁合同等，证明你对厂房的合法权利）。
       
   • 若侵占方为承租人或合作方，需核查原合同条款，确认是否存在违约或超期占用情形。
     

2. 协商或发函要求退还

   • 优先通过书面形式（如律师函）向侵占方明确主张权利，要求其限期搬离并恢复原状。
     
   • 协商时注意保留沟通记录（如邮件、短信、录音等），避免口头协商无凭证。
     

3. 向公安机关报案（若涉嫌刑事犯罪）

   • 若侵占行为伴随暴力、威胁、破坏财物等情节，可能涉嫌《刑法》中的非法侵入住宅罪（若厂房兼具居住功能）或故意毁坏财物罪，可向公安机关报案。
     
   • 公安机关立案后，会依法调查并采取强制措施（如驱离、拘留等）。
     

4. 提起民事诉讼

   • 若协商、报案未果，可向法院提起返还原物纠纷或排除妨害纠纷之诉，要求：
     
     • 侵占方立即搬离厂房；
       
     • 赔偿因侵占导致的损失（如租金损失、设备损坏等）；
       
     • 承担诉讼费用。
       
   • 诉讼中需提交权属证明、侵占证据及损失计算依据，法院判决后若对方拒不履行，可申请强制执行。
     

5. 申请先予执行（紧急情况）

   • 若厂房被侵占导致生产经营严重受阻（如无法按时交货、员工无法作业），可在诉讼中申请先予执行，要求法院裁定侵占方立即搬离，以减少损失。
     

注意事项：

• 避免自行采取过激手段（如断水断电、强行清退），可能涉嫌侵权或违反治安管理规定，需通过法律程序解决。
  
• 若厂房涉及多人共有或复杂权属关系，需先理清内部权利义务，再对外主张。
  

如有进一步细节（如侵占方身份、合同约定、损失情况等），可直接向我咨询，我将结合具体情形提供针对性方案。