与多家分公司签订合同的情况下，能否与总公司确认劳动关系，需视具体情况而定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、分公司具备独立用工主体资格的情况
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第四条，劳动合同法规定的用人单位设立的分支机构，依法取得营业执照或者登记证书的，可以作为用人单位与劳动者订立劳动合同。
实际情况：
- 如果分公司已经依法登记并领取了营业执照，那么它就具备了独立的用工主体资格。在这种情况下，您与分公司签订的劳动合同是有效的，您与分公司之间建立了劳动关系。
- 即便您同时与多家这样的分公司签订了合同，每份合同都是独立的，您与每家分公司都分别建立了劳动关系。此时，若您想与总公司确认劳动关系，在法律上并不直接成立，因为您并未直接与总公司签订劳动合同。但如果您能证明总公司对分公司的管理、控制等达到了实质上构成劳动关系的程度（这种情况较为罕见且复杂），则可能存在例外，不过这通常需要详细的证据和法律分析。
二、分公司不具备独立用工主体资格的情况
法律依据：
- 同样根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第四条，未依法取得营业执照或者登记证书的分支机构，受用人单位委托可以与劳动者订立劳动合同。
实际情况：
- 如果分公司未依法取得营业执照或登记证书，那么它不具备独立的用工主体资格。在这种情况下，分公司与您签订的劳动合同实际上是受总公司委托签订的，相关的法律责任最终由总公司承担。
- 因此，即便您是与分公司签订的合同，但从法律关系上讲，您是与总公司建立了劳动关系。这种情况下，您可以直接与总公司确认劳动关系。
三、建议与注意事项
核实分公司资质：
- 在与分公司签订劳动合同时，务必核实其是否依法取得了营业执照或登记证书。这可以通过查询相关工商登记信息或要求分公司提供证明文件来实现。
明确合同主体：
- 在签订劳动合同时，应明确合同主体是分公司还是总公司。如果合同主体是分公司，且分公司具备独立用工主体资格，那么您与分公司建立了劳动关系；如果合同主体实际上是总公司（即使由分公司代签），那么您与总公司建立了劳动关系。
保留证据：
- 无论与哪家公司签订合同，都应保留好合同原件、工作证、工资单等证据材料。这些证据在将来可能发生的劳动争议中至关重要。
咨询专业律师：
- 如果您对与分公司或总公司确认劳动关系的问题存在疑问或担忧，建议咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况提供准确的法律意见和指导。
总结来说，与多家分公司签订合同的情况下，能否与总公司确认劳动关系取决于分公司是否具备独立用工主体资格。如果分公司具备独立用工主体资格，则您与分公司建立了劳动关系；如果分公司不具备独立用工主体资格，则您实际上与总公司建立了劳动关系。在处理此类问题时，请务必核实分公司资质、明确合同主体、保留证据，并在必要时咨询专业律师。