项目已经竣工，仍然可能因未开设农民工工资专用账户而受到行政处罚。以下从法律背景、处罚依据、实际案例及建议四个方面进行详细分析：
一、法律背景
根据《保障农民工工资支付条例》第二十六条的规定，施工总承包单位应当按照有关规定开设农民工工资专用账户，专项用于支付该工程建设项目农民工工资。这一规定旨在确保农民工工资的按时足额支付，保护农民工的合法权益。
二、处罚依据
《保障农民工工资支付条例》第五十五条第一款明确规定，施工总承包单位未按规定开设或者使用农民工工资专用账户的，由人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门按照职责责令限期改正；逾期不改正的，责令项目停工，并处5万元以上10万元以下的罚款；情节严重的，给予施工单位限制承接新工程、降低资质等级、吊销资质证书等处罚。
三、实际案例
在实际操作中，已有多起因施工总承包单位未开设农民工工资专用账户而受到处罚的案例。例如，义乌市人力社保局劳动监察执法人员在日常巡查中发现，江苏某建筑工程有限公司承建的义乌某项目公区精装修工程项目存在未按规定开设或者使用农民工工资专用账户的违法行为。查明事实后，执法人员依法向该公司下达责令（限期）改正指令书，责令该公司于规定日期前按规定开设或者使用农民工工资专用账户，并将改正情况和相关凭证以书面形式报送至义乌市人力社保局。该公司未按指令书要求进行整改，后被处以罚款5万元的行政处罚。这一案例表明，即使项目已经竣工，如果施工总承包单位未按规定开设农民工工资专用账户，仍然可能受到行政处罚。
四、建议
严格遵守法规：施工总承包单位应严格遵守《保障农民工工资支付条例》的相关规定，确保在项目开工前或规定期限内开设农民工工资专用账户，并专项用于支付农民工工资。
及时整改：如果施工总承包单位在项目竣工后才发现未开设农民工工资专用账户，应立即向相关部门报告并申请整改，以避免受到更严厉的处罚。
加强内部管理：施工总承包单位应加强内部管理，建立健全农民工工资支付制度，确保农民工工资的按时足额支付。
寻求法律帮助：如果施工总承包单位对相关规定或处罚有疑问，应及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。
综上所述，项目已经竣工并不意味着可以免除因未开设农民工工资专用账户而可能受到的行政处罚。施工总承包单位应严格遵守相关法规，确保农民工工资的按时足额支付，以维护自身合法权益和良好的市场秩序。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。