结论前置：未按要求设立农民工工资专户，施工总承包单位将面临责令改正、项目停工、罚款以及情节严重时的更严厉处罚，包括限制承接新工程、降低资质等级、吊销资质证书等。

详细分析：

1. 法律背景与规定：

   • 根据《保障农民工工资支付条例》的相关规定，施工总承包单位应当按照有关规定开设农民工工资专用账户，专项用于支付该工程建设项目农民工工资。这一制度的设计，旨在规范农民工工资支付行为，保障农民工的合法权益，确保工资能够按时足额支付。

2. 对施工总承包单位的影响及法律后果：

   • 责令限期改正：若施工总承包单位未按规定开设或使用农民工工资专用账户，首先会由人力资源社会保障行政部门、相关行业工程建设主管部门按照职责责令限期改正。相关部门会明确要求施工总承包单位在一定期限内完成工资专用账户的开设或规范使用。
   • 项目停工与罚款：如果逾期未改正，相关部门将责令项目停工，并处以5万元以上10万元以下的罚款。具体罚款数额会根据施工总承包单位的违法情节、造成的后果等因素综合确定。
   • 情节严重时的处罚：在情节严重的情况下，施工总承包单位还可能面临限制承接新工程、降低资质等级、吊销资质证书等更为严厉的处罚。这些处罚将严重影响施工总承包单位的业务发展和市场声誉。

3. 对农民工的影响：

   • 农民工工资专用账户的设立，旨在保障农民工工资的按时足额支付。如果未按要求设立，农民工的工资支付将缺乏保障，可能面临工资被挪用、截留的风险，增加经济风险。
   • 同时，如果工资发放未通过专户，工资支付的证据可能不清晰，给农民工维权带来困难，影响其通过法律途径维护合法权益。

4. 案例参考：

   • 在实际操作中，已有多起因施工总承包单位未开设农民工工资专用账户而受到处罚的案例。例如，新疆生产建设兵团某施工总承包单位因未开设农民工工资专用账户，被当地人力资源社会保障局依法责令限期改正，并最终开设了专用账户。而辽宁某施工总承包单位则因拒不开设使用工资专用账户和存储工资保证金，被罚款10万元。

法律建议：

• 立即整改：如果施工总承包单位发现未按要求设立农民工工资专用账户，应立即停止违规行为，开设专户并规范使用。
• 规范工资支付流程：建立健全农民工工资支付管理制度，明确支付流程、标准和时间，确保工资支付的合法性和规范性。同时，加强监督和检查，及时发现并解决问题。
• 妥善处理纠纷：对于已发生的工资纠纷，应积极与农民工协商解决。协商不成时，应引导农民工通过合法途径解决，如申请仲裁或提起诉讼。
• 加强内部管理和制度建设：完善内部管理制度，加强对财务和人事部门的监督，防止违规操作导致的工资发放问题。
• 配合监管部门：积极配合劳动保障监察部门的调查和检查工作，如实提供相关资料和信息，以便及时发现问题并整改。

总结：未按要求设立农民工工资专户是严重的违法行为，不仅会对施工总承包单位造成严重的法律后果，还会影响农民工的合法权益。因此，各施工单位必须严格遵守《保障农民工工资支付条例》的相关规定，确保农民工工资的按时足额支付。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。