医疗期被处理自动离职一般是不合法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、医疗期内的法律规定

根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。这意味着，如果员工在医疗期内，无论其病情如何，用人单位都无权要求其自动离职或解除劳动合同。这是为了保障员工在患病或非因工负伤期间的合法权益，确保其能够得到必要的治疗和休息。

二、医疗期满后的处理

1. 员工能力评估：医疗期满后，用人单位需要对员工的工作能力进行评估。如果员工能够从事原来的工作，或者经过调整岗位后能够从事新的工作，那么用人单位应当继续履行劳动合同。

2. 解除劳动合同的条件：如果医疗期满后，员工既不能从事原来的工作，也不能从事用人单位另行安排的工作，那么用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人，或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。这是法律规定的用人单位在特定情况下可以解除劳动合同的情形。

3. 违法解除的后果：如果用人单位在医疗期满后，未经评估员工的工作能力，也未按照法定程序通知或支付额外工资，就强行要求员工自动离职，那么这种行为是违法的。员工有权向劳动监察部门投诉，要求用人单位继续履行劳动合同或者支付经济赔偿金。

三、员工的维权措施

1. 保留证据：员工在医疗期内和医疗期满后，应当妥善保留医疗证明、工资条等相关证据。这些证据是维护自身合法权益的重要依据。

2. 投诉与维权：如果用人单位违法要求员工自动离职，员工可以向劳动监察部门投诉。劳动监察部门将依法进行调查，并保护员工的合法权益。员工也可以要求用人单位继续履行劳动合同，或者支付经济赔偿金。

3. 法律途径：如果与用人单位协商无果，员工还可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益。

建议：

• 员工在医疗期内应安心治疗，不必担心工作问题。如果用人单位在此期间要求自动离职，应坚决拒绝并保留相关证据。
• 医疗期满后，员工应积极配合用人单位进行工作能力评估。如果确实无法从事原工作或新岗位，应与用人单位协商解决方案。
• 如果遇到用人单位违法解除劳动合同的情况，员工应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。

作为专业律师，我提醒您在面对此类问题时，务必保持冷静并依法维权。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。