用人单位对职工按照自动离职处理是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情形
员工存在严重过错：
- 若员工存在严重违反用人单位规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害等情形，且用人单位有充分证据证明这些情形的存在，并履行了相应的通知等程序，那么用人单位按照自动离职处理员工是合法的。例如，员工无正当理由连续旷工达到一定天数（如3天及以上），或累计旷工达到特定次数（如一个月内5次），用人单位可依据规章制度按自动离职处理。
员工主动辞职且程序合规：
- 若员工主动提出辞职，并按照法定程序提前通知了用人单位（如提前三十日以书面形式通知），那么员工的行为属于合法辞职，用人单位按自动离职处理（在此情境下实际为确认离职）并不违反法律规定。但需注意，若员工与单位签订了服务期协议，且单位为员工提供了专项培训费用，进行了专业技术培训，员工在服务期内自动离职，可能需按照协议约定向单位支付违约金。
二、非法情形
用人单位强迫员工自动离职：
- 若用人单位单方面强迫员工自动离职，而不符合法定解除条件，那么这种行为属于违法行为。例如，用人单位未提供充分证据证明员工存在严重过错，就强行要求员工自动离职，或者通过威胁、利诱等方式迫使员工自动离职，都是不合法的。这种情况下，员工有权拒绝并依法维护自身权益，如要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金等。
未履行法定程序：
- 即使员工存在可按自动离职处理的情形，但用人单位在作出处理决定前未给予员工说明情况的机会，或者处理决定未以书面形式通知员工，那么这种处理决定也可能因程序不合规而被认定为非法。
三、法律要点与建议
规章制度的合法性：
- 用人单位的规章制度必须明确规定自动离职的情形及处理方式，且规章制度的制定需经过民主程序并向员工公示，确保其知晓并接受。这是用人单位合法处理员工自动离职的前提。
程序的合规性：
- 在作出自动离职处理决定前，用人单位应给予员工说明情况的机会，确保处理决定的公正性和合理性。同时，处理决定必须以书面形式通知员工，确保员工对处理结果有明确的认知。
劳动者权益的保护：
- 用人单位在处理自动离职时，应遵循合法、公正、公平的原则，不得侵害劳动者的合法权益。若用人单位存在违法行为导致劳动者被迫自动离职，劳动者有权要求经济补偿。
针对您的情况，我建议您：
- 若您认为用人单位的处理决定不合法，可以与用人单位进行沟通协商，明确表达自己的意愿和诉求。
- 若沟通无果，您可以向劳动监察部门投诉举报用人单位的违法行为，或者直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张自己的合法权益。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。