员工申请仲裁后仍在职，这种情况在法律上是允许的，且不影响员工继续履行工作职责。针对这一情况，我们可以从企业和员工两个角度来详细分析：
企业角度
提供正常工作环境与待遇：
- 企业有义务根据与员工签订的劳动合同条款，为员工提供正常的工作环境以及相应的福利待遇。这包括但不限于工资、社保、福利等。
- 法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规均规定了企业应履行的义务。
避免打击报复或歧视：
- 企业应当避免采取任何可能导致对该名员工进行打击报复或者歧视的行为。这包括但不限于降薪、调岗、解雇等。
- 若企业采取不当行为，员工有权向劳动监察部门投诉，并可能获得相应的法律救济。
正常管理流程：
- 若在员工上班期间，由于仲裁事项的影响而导致其工作效率下降，或者违反了公司的相关规章制度，企业应该依照正常的管理流程来进行处理。
- 同时，企业应保留好相关的证据资料，以备在仲裁过程中使用。但处理这些问题时，务必要保证公正、公平，并严格遵守国家的法律法规以及公司内部的各项规章制度。
员工角度
遵守公司规定：
- 员工在仲裁期间仍应严格遵守公司的各项规章制度，按时上下班，认真履行工作职责。
- 避免因违反公司规定而给公司提供不利于自己的证据。
做好工作记录：
- 员工应保留工作过程中的各类证据，如工作任务分配、完成情况、加班记录、与同事及上级的沟通记录等。
- 这些记录有助于证明自己的工作表现和劳动权益，在仲裁过程中可能起到关键作用。
保持职业态度：
- 员工应以平和、专业的态度与同事和上级相处，避免因劳动仲裁事宜产生冲突。
- 避免情绪化的表达和行为，以免影响自身形象和仲裁结果。
关注仲裁进展：
- 员工应及时了解仲裁的流程和进展情况，按仲裁机构要求提供相关证据和信息。
- 积极配合仲裁工作，确保自身权益得到有效维护。
保护个人权益：
- 若在上班期间，公司存在威胁、报复等不当行为，员工要及时采取措施，如向劳动监察部门投诉或保留相关证据。
- 这些措施有助于员工在仲裁中维护自己的合法权益。
总结与建议：
- 无论是企业还是员工，在仲裁期间都应遵循法律法规，耐心等待仲裁结果的公布。
- 企业应确保员工的合法权益不受侵害，同时维护自身的合法权益。
- 员工应继续履行工作职责，同时关注仲裁进展，保护自己的合法权益。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。