当公司面临员工在职仲裁时，应采取以下全面而系统的应对策略：
一、初步响应与签收文书
及时签收与审查：公司在收到仲裁通知及相关文书后，应立即仔细查看，包括仲裁申请书副本、证据清单、开庭通知等，明确员工的诉求、依据及开庭时间、地点等关键信息。这是应对仲裁的第一步，确保公司对仲裁情况有全面的了解。
初步沟通尝试：主动与提出仲裁的员工进行初步沟通，了解其具体诉求和原因。这有助于为后续的协商或抗辩打下基础，也可能通过沟通解决部分争议，避免进一步的法律程序。
二、组建应对团队与收集证据
组建专业团队：由法务人员牵头，联合人力资源部门相关人员及该员工的直属上级，共同组成应对团队。这个团队将负责整个仲裁过程的应对工作，确保公司有专业的力量来维护自身权益。
全面收集证据：围绕员工的仲裁请求，全面收集和整理相关证据，包括但不限于劳动合同、规章制度、工资支付记录、考勤记录、工作交接记录及沟通记录等。这些证据将用于证明公司的立场和行为的合法性，是仲裁过程中至关重要的环节。
三、沟通与协商
尝试协商和解：在明确员工诉求的基础上，尝试通过协商达成一致意见，避免进一步的法律纠纷。如双方有和解意愿，可制定合理的和解方案，这有助于节省时间和资源，同时维护公司的声誉和员工关系。
寻求第三方调解：若协商无果，可寻求第三方调解组织的帮助，如企业劳动争议调解委员会或基层人民调解组织，进行调解。第三方调解往往能提供更客观、公正的视角，有助于推动双方达成和解。
四、分析仲裁请求与制定应对策略
深入分析请求：应对团队需共同研究员工的仲裁请求，结合收集到的证据进行深入分析，判断其合理性及法律依据。这是制定应对策略的基础，确保公司能够有针对性地回应员工的诉求。
制定应对策略：根据分析结果，制定相应的应对策略。如公司确实存在过错，可考虑和解；如公司无过错，则应积极准备抗辩，确定答辩要点。应对策略的制定需要综合考虑法律、事实和公司利益等多个因素。
五、撰写答辩书与参加仲裁庭审
撰写详细答辩书：在规定时间内提交答辩书，清晰、有条理地阐述公司的观点和理由，附上相关证据清单及说明。答辩书是公司在仲裁过程中表达自身立场和证据的重要文件，需要精心撰写。
积极参加庭审：提前安排好出庭人员，确保其熟悉案件情况、证据和答辩思路。在庭审中遵守纪律，按照仲裁员的指引进行陈述、答辩、举证、质证等环节。庭审是仲裁过程的核心环节，公司需要充分准备并积极参与。
六、加强人事管理与防范法律风险
完善人事管理制度：确保所有新员工均签订书面劳动合同，并明确双方权利义务。定期审查和更新人事管理制度，确保其符合相关法律法规要求。完善的人事管理制度有助于预防劳动争议的发生。
强化员工培训与法律意识：定期对员工进行劳动法律法规培训，提高员工的法律意识。这有助于减少因员工法律意识淡薄而引发的劳动争议。
七、应对恶意仲裁与遵守仲裁裁决
积极应对恶意仲裁：如认为员工存在恶意仲裁行为，应积极收集证据进行反驳，维护公司合法权益。恶意仲裁不仅浪费公司资源，还可能对公司声誉造成负面影响。
严格遵守仲裁裁决：仲裁裁决作出后，公司应严格遵守，按照裁决内容履行相关义务。如对裁决不服，可在法定期限内向人民法院提起诉讼。遵守仲裁裁决是公司的法律义务，也是维护法律尊严和仲裁权威的表现。
公司在面对员工在职仲裁时，应秉持积极、主动的态度，通过沟通、协商、调解、抗辩等多种方式妥善处理纠纷。同时，加强人事管理和法律风险防范工作，以确保公司的稳定和持续发展。如有任何疑问或需要进一步的法律支持，请直接向我咨询。