关于“羁押未判刑期间单位发了工资是否合法”的问题，需要分情况来讨论：
若员工最终被证明无罪：
- 根据相关法律规定和保障员工合法权益的原则，单位应正常支付该期间的工资。已发放的工资，员工无需退还。这是因为员工并未因犯罪而丧失获得劳动报酬的权利，且在其被羁押期间，若最终被证明无罪，其劳动权益应得到保护。
若员工最终被依法追究刑事责任：
- 依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条第六项的规定，用人单位可以解除劳动合同。由于员工在羁押期间未正常提供劳动，单位支付工资的基础不存在，因此单位有权要求员工返还已发放的工资。单位可先与员工协商，协商不成可通过民事诉讼等法律途径，请求法院判决员工返还不当得利。
劳动合同有特殊约定或处于特殊情况：
- 如果单位与员工在劳动合同中有特殊约定，或该期间处于停工停产等特殊情况，工资支付可能会根据具体约定或相关规定进行调整。例如，某些劳动合同可能规定，在员工被限制人身自由期间，单位有权暂停支付工资，或按照一定比例支付生活费。
法律建议：
- 对于单位而言，在处理员工羁押期间的工资问题时，应严格遵守相关法律法规，确保合法合规。同时，建议单位与员工进行充分沟通，明确工资支付的相关事宜，以避免潜在的法律风险和经济纠纷。
- 对于员工而言，如果单位在羁押期间发放了工资，但最终被追究刑事责任，员工应了解自己的权利和义务，积极与单位协商解决工资返还问题。若协商不成，可通过法律途径维护自己的合法权益。
总之，羁押未判刑期间单位发了工资是否合法，需根据员工是否被定罪、判刑以及劳动合同的具体约定来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。