针对您提出的问题“社保按最低基数缴纳签订协议是否合法”，我可以明确地告诉您，这种做法是不合法的。

首先，根据相关规定，社保缴纳基数应为职工上年度平均工资。如果职工的工资低于当地社会平均工资的60%，则按社会平均工资的60%作为缴费基数；如果高于社会平均工资的300%，则按社会平均工资的300%作为缴费基数。因此，公司按最低基数给员工缴纳社保，并不符合这一规定。

其次，即使公司与员工签订了协议，也不能改变这一事实的违法性。因为法律对于社保缴纳有明确的规定，任何协议都不能违反法律法规的强制性规定。如果公司坚持按最低基数缴纳社保，员工有权向相关部门投诉，并要求公司补足社保差额。

此外，还需要注意的是，社保缴纳不仅关乎员工的切身利益，也关系到公司的长远发展和法律合规。如果公司为了降低成本而采取违法手段，不仅可能面临法律风险，还可能影响员工的积极性和忠诚度，从而对公司的整体运营产生负面影响。

因此，我建议您在社保缴纳问题上务必遵守相关法律法规，确保公司和员工的权益得到充分保障。如果您对社保缴纳有任何疑问或需要进一步的咨询，请随时联系当地社保部门或专业律师进行解答。