针对您提出的“考核工时制是否可以要求加班不计加班费”的问题，首先我们需要明确一点：无论是哪种工时制度，加班是否需要支付加班费，主要取决于实际工作时间是否超过了法定标准工作时间。

考核工时制，通常指的是根据工作完成情况或特定考核周期来评估工作时间和效率的一种制度。然而，这并不改变加班的基本法律规定。在大多数国家和地区，包括我国，劳动法都明确规定，如果劳动者的工作时间超过了法定标准工作时间（通常是每日8小时，每周40小时，但具体可能因地区和行业而异），那么超出部分就应当被视为加班，并依法支付加班费。

现在，让我们回到您的问题上来。在考核工时制下，如果单位安排了加班，并且实际工作时间超过了法定标准工作时间，那么单位是需要支付加班费的。单位不能仅因为实行的是考核工时制就拒绝支付加班费。这是不符合劳动法的规定的。

此外，即使您在某种文件上签字确认了加班费已结清，但如果实际上并未足额支付，您仍然有权请求支付欠付的加班费。当然，这取决于您签字时的具体情况，比如是否存在欺诈、胁迫等情形。如果签字是出于自愿，并且双方对加班费已经进行了充分的协商和确认，那么这份协议可能是有效的。但如果单位利用了自己的优势地位，迫使您签字确认加班费已经付清，而实际上并未足额支付，那么这份协议可能是无效的，您仍然有权要求支付欠付的加班费。

综上所述，考核工时制并不能成为单位拒绝支付加班费的理由。如果单位安排了加班，并且实际工作时间超过了法定标准工作时间，那么单位就需要依法支付加班费。同时，劳动者在签署相关协议或文件时，也应熟悉相关条款含义，审慎签订，以避免权利丧失的风险。