公司不能以职务侵占为由拒绝支付你工资。下面我来详细分析这个问题：

一. 公司无权以职务侵占为由拒付工资

1. 工资支付与职务侵占是两个独立的法律关系：根据《劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”公司应当按时支付你的工资，这是公司的法定义务。而职务侵占属于刑事或民事纠纷范畴，与工资支付没有直接的法律关系。
2. 公司不能单方面认定职务侵占：职务侵占需要由公安机关或法院进行认定，公司无权单方面作出认定，并以此为由拒付工资。

二. 公司拒付工资的法律后果

1. 你可以申请劳动仲裁：如果公司拒绝支付工资，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资。
2. 公司可能面临法律处罚：如果公司被认定存在拖欠工资的行为，根据《劳动法》的相关规定，公司可能需要支付赔偿金，并可能面临劳动行政部门的处罚。

三. 职务侵占的相关处理

1. 公安机关会依法处理：如果公司认为你存在职务侵占的行为，应当交由公安机关依法处理。公安机关会进行调查取证，并根据调查结果作出相应的处理。
2. 你的合法权益不受影响：无论职务侵占的调查结果如何，都不影响你要求公司支付拖欠的工资。

我建议：你可以先与公司进行沟通，要求公司支付拖欠的工资。如果公司拒绝支付，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。同时，你也可以咨询当地的劳动行政部门或律师协会，寻求进一步的法律帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。