如果用人单位在未与员工协商的情况下擅自变更劳动合同主体，员工拒绝并因此被辞退，那么员工有权要求经济补偿。具体赔偿标准如下：

1. 经济补偿的计算：

   • 员工在公司工作每满一年的，补偿一个月工资；
   • 半年以上不满一年的，按一年计算，即补偿一个月工资；
   • 不满半年的，向员工支付半个月的工资作为经济补偿；
   • 但最多补偿不超过十二个月的工资。

2. 月工资的定义：

   • 此处所指的“月工资”是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

3. 特殊情况：

   • 如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付；
   • 向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，才可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。如果用人单位未与员工协商就擅自变更劳动合同主体，员工有权拒绝，并有权在因此被辞退时要求经济补偿。

综上所述，如果用人单位擅自变更劳动合同主体且员工因此被辞退，员工可以根据上述标准计算应得的经济补偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。