结论前置：对于“工资5000元，病假5天扣多少钱”的问题，具体扣除金额需结合所在用人单位的规章制度、劳动合同约定以及当地关于病假工资的规定来确定。以下我会从多个角度进行详细分析，并给出计算公式及示例。

一、病假工资的计算原则

1. 计算基数：

   • 劳动合同有约定的，按不低于约定的劳动者本人所在岗位（职位）相对应的工资标准确定。
   • 劳动合同未约定的，可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，或按劳动者本人正常出勤月工资的70%确定，但不得低于当地最低工资标准。假设此处月工资5000元即为计算基数。

2. 支付比例（计算系数）：

   • 病假工资的支付比例通常与员工的连续工龄相关。例如，连续工龄满2年不满4年的，病假工资可能按本人工资的70%计发（具体比例需根据当地规定或劳动合同确定）。

3. 日工资计算：

   • 日工资 = 月工资收入 ÷ 21.75天（法定月计薪天数）。

二、具体计算方式

假设连续工龄满2年不满4年，病假工资支付比例为70%，则：

1. 计算日工资：

   • 日工资 = 5000元 ÷ 21.75天 ≈ 229.89元。

2. 计算病假日工资：

   • 病假日工资 = 日工资 × 支付比例 = 229.89元 × 70% ≈ 160.92元。

3. 计算5天病假工资：

   • 5天病假工资 = 病假日工资 × 5天 ≈ 804.60元。

4. 计算应扣工资：

   • 应扣工资 = 5天正常工资 - 5天病假工资 = 229.89元 × 5天 - 804.60元 ≈ 344.85元。

三、特殊情况与注意事项

1. 最低工资标准保障：

   • 病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。如果计算出的病假工资低于此标准，应按最低工资标准的80%支付。

2. 地区差异：

   • 不同地区对于病假工资的规定可能存在差异。例如，某些地区可能有特定的病假工资支付标准或计算方法。因此，在计算病假工资时，需参照当地的具体规定执行。

3. 公司政策与福利：

   • 除了法律法规外，用人单位的规章制度也可能对病假工资的计算有所规定。例如，公司可能有带薪病假政策或其他相关福利制度，这会影响实际扣除金额。

4. 证据保留：

   • 如因病假工资问题与公司发生争议，应保留好相关证据，如病假条、工资条、劳动合同等，以便维权。

四、示例总结

以月工资5000元，连续工龄满2年不满4年，病假5天为例：

• 日工资：约229.89元。
• 病假日工资：约160.92元。
• 5天病假工资：约804.60元。
• 应扣工资：约344.85元（此数值为示例，实际扣除金额需根据具体情况调整）。

综上所述，具体扣除金额需根据所在地区的法律规定、公司规章制度以及个人具体情况进行计算。如果你有更详细的信息或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。