结论：工作已超两年，通常不能再主张双倍工资差额的赔偿，但可以通过其他法律途径来维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与解读
《劳动合同法》第八十二条：明确规定了用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这一规定的主要目的是督促用人单位及时与劳动者签订书面劳动合同，从而保障劳动者的合法权益。然而，当工作年限超过一年时，这一条款的直接适用性就不存在了。
《劳动争议调解仲裁法》第二十七条：规定了劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这意味着，如果劳动者在一年内未主张其权利（如双倍工资差额），可能会因超过仲裁时效而丧失胜诉权。对于工作已超两年的情况，显然已经超过了这一时效期间。
《劳动合同法实施条例》第七条：进一步明确了用人单位自用工之日起满一年未与劳动者订立书面劳动合同的法律后果。即，自用工之日起满一个月的次日至满一年的前一日，用人单位应当依照《劳动合同法》第八十二条的规定向劳动者每月支付两倍的工资，并视为自用工之日起满一年的当日已经与劳动者订立无固定期限劳动合同。这一规定实际上已经排除了工作超过一年后再主张双倍工资差额的可能性。
二、实际案例与司法实践
在实际案例中，法院通常会根据上述法律规定，结合具体案情来判断劳动者是否有权主张双倍工资差额。例如，在某起劳动争议案件中，劳动者入职后一直未与用人单位签订书面劳动合同，直至工作超过一年。法院经审理认为，虽然用人单位存在未依法签订书面劳动合同的违法行为，但劳动者在一年内未主张双倍工资差额的权利，且已超过仲裁时效，因此驳回了劳动者的诉讼请求。
三、劳动者权益保护的其他途径
尽管工作已超两年未签订劳动合同的劳动者可能无法再主张双倍工资差额的赔偿，但他们仍可通过其他法律途径来维护自身权益：
要求补签劳动合同：劳动者可以要求用人单位与其补签书面劳动合同，以明确双方的权利和义务。这有助于保障劳动者的合法权益，避免未来可能出现的劳动纠纷。
主张无固定期限劳动合同：根据法律规定，用人单位自用工之日起满一年不与劳动者订立书面劳动合同的，视为已订立无固定期限劳动合同。劳动者可以据此主张与用人单位建立无固定期限劳动关系，从而获得更稳定的就业保障。
追究用人单位的法律责任：对于持续违法且拒不改正的用人单位，劳动者可以向劳动行政部门投诉举报。劳动行政部门有权对用人单位进行查处和处罚，以维护劳动者的合法权益和劳动市场的秩序。
建议：如果你正面临类似的情况，建议首先与用人单位进行协商，尝试通过友好方式解决问题。如果协商无果，你可以考虑向劳动行政部门投诉举报或寻求法律援助。作为专业律师，我能够为你提供详细的法律咨询和代理服务，帮助你维护自身权益。如果你有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。