结论前置：公司发工资只发一半，在大多数情况下是不合法的。不过，也存在一些特殊情况可能使得这一行为合法。下面我将从多个角度为你详细分析。
一般情况下的不合法性
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》第七条也强调，工资必须在约定的日期支付，且至少每月支付一次。《中华人民共和国劳动合同法》第三十条进一步明确了用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，及时足额支付劳动报酬的义务。
分析：在一般情况下，如果公司没有合理合法的原因，只发放一半工资，就构成了克扣工资，这明显违反了上述法律规定。劳动者在遭遇此类情况时，有权依法向当地人民法院申请支付令，要求用人单位支付应得的全部工资。
特殊情况下的合法性分析
协商一致
- 情况说明：若用人单位与劳动者经过平等协商，达成一致意见，比如劳动者因个人原因提出先领取一半工资，且用人单位同意，这种情况视为双方在自愿、平等的基础上对工资支付方式进行了变更，因此是合法的。
- 举例：小李因家庭突发状况，急需用钱，便与公司协商先领取一半工资，剩余部分下个月补发。公司同意了小李的请求，并签订了书面协议。这种情况下，公司发一半工资就是合法的。
法定扣除情形
- 情况说明：用人单位可在法律允许的范围内代扣费用，如个人所得税、社会保险费用等。但扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。若扣除后剩余工资仍不低于最低工资标准，则此情况是合法的。
- 举例：小张的月工资为5000元，当地最低工资标准为2000元。公司按照法律规定代扣了小张的个人所得税和社保费用后，剩余工资为4000元，高于最低工资标准。这种情况下，公司发4000元（即原工资的一部分）是合法的。
经营困难与工资调整
- 情况说明：企业因自然灾害、战争等非人力所能抗拒的原因无法按时支付工资，或因生产经营困难、资金周转受影响而暂时延期支付工资（最长不得超过30日），并在征得本单位工会同意后与劳动者协商一致，先发放一半工资，待经营状况好转后再补发剩余部分，此情况在法律允许范围内。
- 举例：某公司因市场环境变化，生产经营出现困难，资金周转紧张。公司征得工会同意后，与员工协商一致，先发放一半工资，并承诺在三个月内补发剩余部分。这种情况下，公司发一半工资也是合法的。
劳动者权益保护与用人单位责任
劳动者权益保护：
- 劳动者在遭遇工资未足额支付时，应积极维护自己的合法权益。可以先尝试与公司沟通协商，了解原因并要求解决方案。若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，乃至提起诉讼以维护自身合法权益。
- 辞职时，劳动者有权要求用人单位支付全部应得工资。若被拒绝，可通过法律途径追究其法律责任。
用人单位责任与后果：
- 用人单位应严格遵守国家法律法规，按时足额支付工资。若未按照劳动合同约定或国家规定及时足额支付劳动报酬，劳动行政部门可责令其限期支付，并可能要求其支付赔偿金。
建议：如果你遇到了公司发工资只发一半的情况，首先尝试与公司沟通协商，了解具体原因并要求解决方案。如果协商无果，你可以收集相关证据（如工资条、银行流水明细、劳动合同等），向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在整个过程中，保留好相关证据是至关重要的。如果你需要进一步的法律帮助或咨询，可以直接向我提问，我会为你提供专业的法律意见。