公司发工资只发一部分是否违法，需根据具体情况判断。以下从多个角度进行分析：

1. 劳动合同与工资构成约定

   • 若劳动合同中明确约定了工资构成及发放方式：例如，工资分为基本工资和绩效工资两部分，且基本工资部分不低于当地最低工资标准，那么公司按照约定只发放基本工资（在绩效不达标等符合合同约定的情形下）可能是合法的。但需注意，若合同中约定了除基本工资外的其他固定工资组成部分（如岗位津贴、固定奖金等），而公司未发放，则可能构成违约。
   • 若劳动合同未明确约定工资构成：但公司规章制度或双方口头约定了工资发放方式，且该方式不违反法律法规的强制性规定（如不低于最低工资标准），那么公司按照约定发放部分工资也可能是合法的。然而，口头约定存在举证困难的风险，建议尽量以书面形式明确。

2. 最低工资标准保障

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条：用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。因此，无论公司如何发放工资，都必须确保劳动者在提供正常劳动的情况下，获得的工资总额（包括所有固定和浮动部分）不低于当地最低工资标准。若公司发放的工资低于此标准，则构成违法。

3. 特殊情况下的工资发放

   • 经营困难或不可抗力：当企业面临严重经营困难或遭遇不可抗力（如自然灾害、疫情等）时，可依据相关法律法规（如《关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》）与员工协商调整薪酬、轮岗轮休或缩短工时。此时，公司需通过民主程序制定方案，并优先保障员工基本权益。若协商一致且方案合法，公司发放部分工资可能是合法的。
   • 试用期或特殊岗位：试用期内工资不得低于本单位相同岗位最低档工资的80%或劳动合同约定工资的80%，且不得低于当地最低工资标准。对于销售等特殊岗位，若采用“低底薪+高提成”模式，需在合同中明确约定并符合行业惯例。若公司违反这些规定，仅发放部分工资则可能构成违法。

4. 工资发放的合法性与合理性

   • 合法性：公司发放工资必须遵守国家法律法规的强制性规定，如按时足额支付、不得克扣或无故拖欠等。若公司存在逃避纳税义务、以非法手段降低工资成本等行为，则构成违法。
   • 合理性：即使公司发放工资的方式在法律上没有问题，但若该方式显失公平或不合理（如长期以极低的基本工资维持劳动关系，而将大部分工资作为不确定的绩效工资发放），也可能引发劳动争议。因此，公司在制定薪酬制度时，应充分考虑员工的合理期望和劳动价值。

建议与行动指南：

• 与公司沟通协商：若您对公司发放工资的方式有疑问或不满，首先应与公司进行沟通协商，要求公司说明原因并解决问题。
• 保留相关证据：在沟通过程中，注意保留相关证据（如工资条、劳动合同、公司规章制度等），以便在必要时维护自己的合法权益。
• 寻求法律援助：若沟通无果或公司存在违法行为，您可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补足工资差额并承担相应的法律责任。在此过程中，如有需要，可随时向我咨询相关法律问题。