公司让员工只上半天班并发一半工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若符合劳动合同约定或双方协商一致：

   • 工作时间安排：如果公司因经营状况调整、业务阶段性变化或其他合理原因，与员工协商一致，决定让员工只上半天班，并且这半天的工作时间不超过法定工时（每日不超过8小时，每周不超过44小时，同时保证每周至少休息一日），那么这种工作时间安排是合法的。
   • 工资支付：在双方协商一致的情况下，公司应按照劳动合同的约定或双方新达成的协议支付工资。如果劳动合同中明确规定了在这种情况下工资的支付方式，且该方式不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定支付一半工资（或相应比例工资）也是合法的。但需注意，若未安排工作的另外半天，公司需按照当地最低生活保障标准或其他相关法律规定支付生活费（如有相关规定），而不能直接扣除全部另一半工资且不支付任何费用。

2. 若未经协商擅自决定或违反法律法规：

   • 工作时间安排：如果公司未经员工同意，擅自决定让员工只上半天班，且这种安排导致员工的工作时间虽然未超法定工时，但影响了员工的正常收入和生活，或者公司以此为由进行裁员前的“软裁员”等不正当目的，那么这种工作时间安排可能是不合法的。
   • 工资支付：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果公司未经协商擅自扣除员工一半工资，且未按照当地最低生活保障标准或其他相关法律规定支付生活费（如有相关规定），那么这种工资支付方式是不合法的。员工有权要求公司补发被扣除的工资，并可能因此向劳动争议调解委员会申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼。

法律建议：

• 员工角度：如果你认为公司只让上半天班并发一半工资的安排不合理或违法，应先与公司进行友好协商，表达你的诉求和理由。如果协商无果，你可以依法向劳动争议调解委员会申请调解，或者直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在仲裁或诉讼过程中，你需要提供相关证据证明公司存在违法行为，如劳动合同、工资条、工作安排通知等。
• 公司角度：公司应遵守相关法律法规，确保员工的权益不受侵害。如果因经营状况调整等原因需要调整员工的工作时间或工资支付方式，应提前与员工进行协商，并达成一致意见。同时，公司应确保调整后的工作时间和工资支付方式符合法律法规的强制性规定。

可能法律后果：

• 如果公司未经协商擅自扣除员工工资或违反法律法规关于工作时间和工资支付的规定，劳动保障行政部门将责令公司限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额等；逾期不支付的，还将责令公司按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。

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