员工在上班途中遭遇车祸，其工资的计算与发放确实是一个涉及多方面因素的问题，主要包括事故责任认定、工伤认定结果以及公司的具体政策。以下是对此问题的详细解答：
一、事故责任与工伤认定
非本人主要责任的交通事故：
- 如果员工在上班途中发生的交通事故并非由其本人承担主要责任，根据《工伤保险条例》的相关规定，这种情况应当被认定为工伤。
- 认定为工伤后，员工将享受工伤保险待遇，这包括医疗费用的报销以及停工留薪期内的工资支付。
本人主要责任的交通事故：
- 如果员工在上班途中发生的交通事故是由其本人承担主要责任，那么这种情况将不被认定为工伤。
- 在这种情况下，员工的工资计算将依据公司的病假或事假制度进行。
二、工资计算方式
认定为工伤的情况：
- 停工留薪期工资：根据《工伤保险条例》的规定，员工在停工留薪期内，其原工资福利待遇将保持不变，并由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，但在伤情严重或情况特殊时，可经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后适当延长，但延长不得超过12个月。原工资福利待遇通常指的是员工受伤前12个月的平均工资，这包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资。
- 生活护理费（如适用）：如果员工因工伤导致生活不能自理，那么还需要支付生活护理费。
未认定为工伤的情况：
- 病假工资：如果员工因交通事故受伤需要请假治疗，并且公司认可其病假申请，那么公司将按照病假工资标准支付工资。病假工资的具体数额可能因地区和公司政策而异，但通常不得低于当地最低工资标准的80%。
- 事假处理：如果员工因个人原因（如本人主要责任的交通事故）导致无法正常工作，并且公司不认可其病假申请，那么可能会按事假处理。在事假期间，员工通常不会获得工资收入，但公司可能根据其人性化政策提供一定的补助。
三、操作建议与注意事项
及时报告与申请：员工在发生交通事故后，应尽快向公司报告，并按照公司规定提交相关证明材料以申请工伤认定或病假。
保留证据：员工应妥善保留交通事故的相关证据，如交警部门的事故认定书、医疗费用发票等。这些证据在后续申请工伤保险待遇或与公司协商赔偿事宜时将起到关键作用。
法律咨询：如果员工对工资计算或工伤认定有疑问，可以咨询专业律师或当地劳动监察部门以获取更准确的法律意见。
综上所述，员工在上班途中遭遇车祸后的工资计算与发放是一个复杂的问题，需要根据具体情况来确定。建议员工在遭遇此类问题时保持冷静，及时报告并申请工伤认定或病假，同时保留好相关证据，并依法维护自身权益。