结论：在一审庭审结束后被告又提交新证据的情况下，原告可以选择发表质证意见，也可以选择不同意质证，但不同意的后果及法律影响需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：
一、原告可以选择发表质证意见
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，庭审结束后，如果一方当事人提交了新的证据，法院通常会组织双方进行质证，以确保案件的公正审理。
- 质证是诉讼过程中的重要环节，原告有权对被告提交的新证据进行质证，提出自己的意见和反驳。
质证内容：
- 原告可以针对新证据的真实性、合法性、关联性进行质证，提出证据是否真实、是否合法取得、是否与案件有关联等意见。
- 原告还可以就新证据对案件事实的影响、对法律适用的影响等发表看法。
质证方式：
- 原告可以在法院组织的质证程序中，通过口头或书面方式发表质证意见。
- 如果法院未组织质证程序，原告也可以向法院提交书面质证意见，说明对新证据的看法。
二、原告可以选择不同意质证及其后果
不同意质证的理由：
- 原告可能认为新证据与案件无关，或者认为被告提交新证据的时间不符合法律规定（如超过举证期限），因此选择不同意质证。
- 原告也可能基于其他合理理由，如认为新证据不真实、不合法等，选择不同意质证。
不同意的后果：
- 法院可能采纳新证据：如果原告不同意质证，但法院认为新证据与案件有关联且真实合法，法院可能会采纳该证据作为认定案件事实的依据。
- 影响原告权益：如果新证据对原告不利，且原告未进行质证，可能导致法院在认定案件事实时对原告不利，进而影响原告的权益。
- 可能丧失反驳机会：原告不同意质证可能意味着放弃了对新证据的反驳机会，如果新证据确实存在问题，原告可能因此失去了指出问题并反驳的机会。
法律建议：
- 谨慎选择：原告在决定是否同意质证时，应谨慎考虑新证据对案件的影响以及自己的权益保护。
- 及时沟通：如果原告对被告提交的新证据有异议，应及时与法院沟通，说明自己的看法和理由。
- 准备反驳：如果原告决定同意质证，应提前准备好反驳意见和证据，以便在质证程序中有效维护自己的权益。
三、特殊情况下的处理
如果新证据是在庭审结束后才发现的：
- 根据法律规定，如果一方当事人在庭审结束后才发现新的证据，且该证据对案件事实的认定有重要影响，法院可能会允许该方当事人提交新证据并组织质证。
如果原告认为新证据的提交违反了举证期限：
- 原告可以向法院提出异议，说明被告提交新证据的时间超过了举证期限，并请求法院不予采纳该证据。法院将根据具体情况判断是否采纳原告的异议。
进一步思考：在实际操作中，原告在面对被告提交的新证据时，应综合考虑案件的具体情况、新证据的性质和影响以及自己的权益保护等因素来决定是否同意质证。如果原告对新证据有异议或认为其不真实、不合法等，应及时向法院提出并说明理由。同时，原告也应积极准备反驳意见和证据，以便在质证程序中有效维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。