结论：法院判决写明经查违法转包，在符合一定条件下，是可以认定工伤的。以下从不同角度为你详细分析：

违法转包与工伤认定的法律关系

根据《工伤保险条例》以及相关司法解释，在违法转包的情形下，如果劳动者在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者符合其他应当认定为工伤的情形，那么该劳动者是可以被认定为工伤的。违法转包本身并不影响工伤的认定，关键在于劳动者所受伤害是否符合工伤认定的法定条件。

例如，某建筑公司将工程违法转包给不具备用工主体资格的自然人，该自然人雇佣的工人在施工过程中受伤。此时，尽管存在违法转包行为，但只要工人是在工作时间、工作场所内，因工作原因受伤，就应当被认定为工伤。

违法转包中责任主体的确定

在违法转包的情况下，确定工伤认定的责任主体是关键。根据相关规定，违法转包的单位（即发包方）和具备用工主体资格的承包方（如果有）需要承担工伤保险责任。如果承包方不具备用工主体资格，那么发包方需要承担用工主体责任，包括工伤保险责任。

具体来说，如果建筑公司将工程违法转包给不具备用工主体资格的自然人甲，甲雇佣的工人乙在施工中受伤。此时，建筑公司作为发包方，需要承担工伤保险责任，为乙申请工伤认定并支付相应的工伤保险待遇。

实际操作中的注意事项

1. 证据收集：在申请工伤认定时，劳动者需要收集相关证据来证明自己与用人单位之间存在劳动关系（尽管在违法转包情况下可能不存在传统意义上的劳动关系，但存在事实劳动关系或用工关系），以及自己是在工作时间、工作场所内因工作原因受伤。这些证据可以包括工资支付记录、工作证、考勤记录、证人证言等。
2. 申请流程：劳动者或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。社会保险行政部门会自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。
3. 争议解决：如果用人单位不认为是工伤，或者对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。在这个过程中，劳动者需要积极维护自己的合法权益，提供充分的证据来支持自己的主张。

建议：如果你遇到了因违法转包而导致的工伤认定问题，建议你及时收集相关证据，并按照规定的流程申请工伤认定。如果在这个过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。