结论：违法分包给有用人资质但无施工资质的公司，发生工伤时，应由具备用工主体资格的承包单位承担工伤保险责任。
法律背景与依据：
《关于确立劳动关系有关事项的通知》第四条：明确规定了建筑施工、矿山企业等用人单位将工程（业务）或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人时，对该组织或自然人招用的劳动者，由具备用工主体资格的发包方承担用工主体责任。这一规定同样适用于违法分包给有用人资质但无施工资质的公司的情况。
《人力资源和社会保障部关于执行〈工伤保险条例〉若干问题的意见》第七条：进一步明确了具备用工主体资格的承包单位在违法分包情况下，应承担工伤保险责任。即，如果承包单位违反法律、法规规定，将承包业务转包、分包给不具备用工主体资格的组织或者自然人，该组织或者自然人招用的劳动者从事承包业务时因工伤亡的，由该具备用工主体资格的承包单位承担用人单位依法应承担的工伤保险责任。
《中华人民共和国民法典》第七百九十一条第三款：禁止承包人将工程分包给不具备相应资质条件的单位。这一规定强调了施工资质的重要性，也间接支持了违法分包情况下，由具备用工主体资格的承包单位承担工伤保险责任的观点。
《最高人民法院关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》第三条第四项：也明确规定了用工单位违反法律、法规规定将承包业务转包给不具备用工主体资格的组织或者自然人时，该组织或者自然人聘用的职工从事承包业务时因工伤亡的，用工单位为承担工伤保险责任的单位。
责任分析：
承包单位责任：作为具备用工主体资格的一方，承包单位在违法分包的情况下，仍需对分包过程中发生的工伤事故承担责任。这是因为承包单位在分包时未尽到审查义务，选择了不具备施工资质的公司进行分包，从而增加了工伤事故的风险。
无资质主体责任：虽然无资质主体实际参与了工程的施工，但由于其不具备用工主体资格和施工资质，因此不能作为工伤保险责任的承担者。无资质主体与劳动者之间可能形成雇佣关系或其他法律关系，但这并不改变承包单位作为工伤保险责任主体的地位。
劳动者权益保障：劳动者在工作中遭受事故伤害或患职业病时，有权享受工伤保险待遇。无论承包单位是否违法分包，都不能剥夺劳动者享受工伤保险待遇的权利。
实践建议：
工伤认定：劳动者发生工伤后，应及时向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请。社会保险行政部门将根据相关法律法规和事实情况，作出工伤认定决定。
工伤保险待遇支付：经认定为工伤的劳动者，有权获得相应的工伤保险待遇。承包单位应按照法律法规的规定，及时足额支付工伤保险待遇。如果承包单位拒绝支付或拖延支付，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益。
预防措施：为了避免类似纠纷的发生，承包单位在分包时应严格审查分包单位的资质和信誉，确保分包单位具备相应的施工资质和用工主体资格。同时，承包单位还应加强对分包单位的管理和监督，确保分包工程的安全和质量。
总结：违法分包给有用人资质但无施工资质的公司，发生工伤时，应由具备用工主体资格的承包单位承担工伤保险责任。这是基于相关法律法规的规定和实践中的处理原则得出的结论。因此，承包单位在分包时应严格遵守法律法规的规定，确保分包单位的资质和信誉符合要求，以避免不必要的法律纠纷和损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。