结论：超出工时加班存休是否违法，需根据具体情况判断，关键在于是否遵守了法律规定的加班时长限制和协商程序。以下从不同角度进行分析：
一、合法的超出工时加班存休情形
加班时长符合法律限制且程序合法：
- 根据《劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；特殊情况下，保障劳动者身体健康的前提下，每日延长不得超过三小时，每月累计不得超过三十六小时。若超出工时加班存休是在这个范围内，并且已经与工会和劳动者进行了充分协商，那么这种行为是合法的。
- 举例：企业与工会及员工协商一致后，安排员工每日加班2小时，连续5天（共10小时），且将这部分加班时间存休，用于后续调休，此行为合法。
支付加班费或安排补休：
- 如果超出工时的加班无法安排补休，用人单位需按照《劳动法》第四十四条的规定支付加班费。若用人单位已经按照法律规定支付了加班费，或者安排了补休（存休可视为一种补休方式），那么这种超出工时的加班存休也是合法的。
- 举例：员工在周末加班，用人单位无法安排补休，但按照法律规定支付了200%的工资报酬，或者将这部分加班时间存休，用于后续调休，此行为合法。
二、违法的超出工时加班存休情形
加班时长超过法定限制：
- 即便用人单位将超出工时的加班存休，用于后续调休，但如果每月加班时间超过36小时，仍属违法行为。
- 举例：工厂长期安排员工每天加班4-5小时，导致月加班总时长远超36小时，即使将这部分加班时间存休，也违反了法律规定。
未遵循法定程序：
- 用人单位未经与工会和劳动者协商，擅自安排加班，即使事后将加班时间存休，也是违法的。
- 举例：公司未与员工协商，直接要求周末加班，并将加班时间存休，侵犯了员工的休息权和协商权，属于违法行为。
三、法律建议
- 遵守法律限制：用人单位应严格遵守《劳动法》关于加班时长的限制，确保每月加班时间不超过36小时。
- 遵循协商程序：在安排加班前，应与工会和劳动者进行充分协商，确保加班行为的合法性。
- 合理安排补休或支付加班费：对于无法安排补休的加班，应按照法律规定支付加班费，保障劳动者的合法权益。
后续行动建议：如果您或您所在的企业面临超出工时加班存休的问题，建议首先审查加班时长是否超过法定限制，以及是否遵循了协商程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。