针对您提出的问题，我的结论是：员工提交虚假材料骗取劳动合同的行为，既可能涉及劳动仲裁追回已发工资的问题，也可能涉及直接向法院起诉诈骗的问题，具体取决于行为的性质和后果。以下是我从不同角度为您详细分析：
劳动仲裁追回已发工资的角度：
- 行为性质：如果员工提交虚假材料骗取劳动合同，但并未构成刑法上的诈骗罪，而是属于劳动合同法上的欺诈行为，那么用人单位可以通过劳动仲裁的方式追回已发放的工资。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的，劳动合同无效或者部分无效。用人单位可以依据此条款，通过劳动仲裁主张劳动合同无效，并要求员工返还已发放的工资。
- 操作流程：用人单位需要收集员工提交虚假材料的证据，如虚假学历证书、工作经历证明等，然后向当地劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求确认劳动合同无效并追回已发放的工资。
直接向法院起诉诈骗的角度：
- 行为性质：如果员工提交虚假材料骗取劳动合同的行为，同时构成了刑法上的诈骗罪，那么用人单位可以直接向法院起诉员工诈骗。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。如果员工的行为符合诈骗罪的构成要件，用人单位可以依法向法院提起刑事诉讼。
- 操作流程：用人单位需要收集员工提交虚假材料的证据，以及员工因此获得的财物（如工资、奖金等）的证据，然后向当地公安机关报案，由公安机关立案侦查。如果公安机关认为构成犯罪，将移送检察院审查起诉，最终由法院进行审判。
额外建议：
- 在处理此类问题时，用人单位应首先评估员工行为的性质和后果，选择最合适的法律途径来维护自身权益。
- 如果员工的行为既涉及劳动仲裁又涉及刑事诉讼，用人单位可以同时采取两种途径，但需要注意两者之间的法律关系和程序衔接。
- 在整个过程中，用人单位应妥善保管相关证据，如劳动合同、员工提交的虚假材料、工资发放记录等，以便在需要时提供证明。
可能面临的法律后果：
- 如果通过劳动仲裁追回已发工资，用人单位可能面临仲裁费用、时间成本等。
- 如果直接向法院起诉诈骗，用人单位需要承担刑事诉讼的举证责任，如果证据不足或行为不构成犯罪，可能面临败诉的风险。
总结：员工提交虚假材料骗取劳动合同的行为，既可能涉及劳动仲裁追回已发工资的问题，也可能涉及直接向法院起诉诈骗的问题。用人单位应根据具体情况选择合适的法律途径来维护自身权益，并妥善保管相关证据。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。