结论：公司进行工资结构重组时，明确表示“孕期不影响”是合理的，但具体是否真正不影响，需看重组方案的具体内容以及是否符合相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：
一、公司表述的合理性
公司承诺的积极意义：公司明确表示“孕期不影响”，从积极的角度看，这体现了公司对孕期员工权益的尊重和保护，有助于维护良好的员工关系和企业形象。
需关注具体方案：然而，公司的这一表述只是原则性的，具体是否真正不影响孕期员工的权益，还需看工资结构重组的具体方案。如果重组方案中涉及降低孕期员工工资、福利或调整其工作岗位等不利于孕期员工的条款，那么公司的这一表述就可能只是口头上的承诺，缺乏实际保障。
二、法律法规的保障
孕期保护的相关规定：根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，孕期女职工享有特殊的劳动保护权益，包括但不限于不得降低工资、不得解除劳动合同、享受产假及产假期间的工资待遇等。
工资结构重组的合法性：公司在进行工资结构重组时，必须遵守相关法律法规的规定，不得损害孕期女职工的合法权益。如果重组方案违反了相关法律法规，那么该方案就是无效的，孕期女职工有权拒绝执行，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
三、实际操作中的建议
审查重组方案：作为孕期员工，在面对公司工资结构重组时，应仔细审查重组方案的具体内容，特别是涉及自己权益的部分。如果发现方案中有不利于自己的条款，应及时与公司沟通协商，要求公司进行修改或提供合理的解释。
保留证据：在与公司沟通协商的过程中，应保留好相关证据，如邮件、聊天记录、会议纪要等。这些证据在后续可能发生的纠纷中，将起到至关重要的作用。
寻求法律援助：如果与公司沟通协商无果，或者公司坚持执行不利于自己的重组方案，孕期员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。作为专业律师，我可以为你提供具体的法律建议和帮助。
总结与进一步思考：公司在进行工资结构重组时，应充分考虑孕期员工的特殊权益，确保重组方案符合相关法律法规的规定。作为孕期员工，也应积极维护自己的合法权益，仔细审查重组方案，保留好相关证据，并在必要时寻求法律援助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。