以房抵债协议被认定无效时，工程价款优先受偿权的起算时间仍以合同约定的竣工日期或实际竣工日期为准，但需结合具体情形判断。以下分情况详细说明：

1. 以房抵债协议本身不影响优先受偿权起算点的核心规则
   根据《民法典》第807条及《建设工程司法解释（一）》第27条，工程价款优先受偿权的行使期限为18个月，自发包人应当给付建设工程价款之日起算。这里的“应当给付之日”通常指：

   • 合同约定的竣工日期；
     
   • 实际竣工日期（若工程未如期竣工）；
     
   • 合同解除或终止之日（若合同未履行完毕）。
     以房抵债协议本质是债务履行方式的变更，若协议被认定无效（如因流押条款违法、恶意串通损害第三人利益等），仅导致“以房抵债”这一履行方式失效，但原工程价款债务仍存在，优先受偿权的起算点仍应回归到上述法定标准，而非以房抵债协议签订或失效之日。

2. 需注意以房抵债协议无效可能引发的关联问题

   • 若以房抵债协议导致工程款支付时间变更：例如，协议约定“工程竣工后以房屋抵债，无需支付现金”，此时需判断该约定是否实质变更了原合同中的付款期限。若变更后的付款期限明确（如抵债房屋交付时间），且该期限晚于原合同约定竣工日期，则优先受偿权起算点可能顺延至抵债房屋应交付之日（需结合具体协议条款分析）。
     
   • 若以房抵债协议被撤销后，发包人拖延付款：承包人需在法定18个月期限内主张优先受偿权，否则可能丧失权利。此时，优先受偿权的行使期限不因协议无效而中断或延长，承包人应及时通过诉讼或仲裁确认债权并主张优先权。

3. 实务建议

   • 承包人应固定原工程价款债务的证据（如施工合同、结算文件等），避免因以房抵债协议无效导致债务金额或付款时间争议。
     
   • 若以房抵债协议被认定无效，立即向发包人书面催告支付工程款，并保留催告证据，以证明“应当给付之日”的起算点。
     
   • 优先受偿权的行使需通过诉讼或仲裁程序确认，承包人应在期限内提起程序，避免权利丧失。

总结：以房抵债协议无效本身不改变工程优先受偿权的起算规则，但需结合协议内容判断是否影响付款期限的认定。承包人应重点关注原合同约定的付款节点，并在法定期限内及时主张权利。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。