结论：公司违法时，员工是否会被牵连主要取决于员工对公司违法行为的知情程度、参与程度以及所担任的职责。若员工不知情且未参与，通常不会被牵连；若员工明知并参与，或负有管理职责却未尽责，则可能被追究相应法律责任。以下是对这一结论的详细分析：
一、员工无牵连情形
完全不知情且未参与：
- 如果员工对公司的违法活动完全不知情，且没有实际参与到任何违法活动中，那么他们通常不会被牵连。例如，基层员工对公司高层的商业贿赂行为毫不知情且无关联，这种情况下，基层员工通常不会受到法律追究。
仅执行正常工作职责：
- 员工按照公司的正常工作安排和流程履行本职工作，主观上无违法故意，客观上工作内容也不属于违法活动的一部分，那么他们不会被认定为违法。如人力资源部门员工在未参与公司其他部门的违法经营行为时，不会因此受牵连。
二、员工可能被牵连情形
直接参与违法活动：
- 如果员工直接参与了公司的违法活动，如财务造假、商业贿赂等，并实施了具体违法行为（如编制虚假账目、提供虚假数据或实施贿赂行为），则该员工将可能面临法律责任。其行为被视为共犯，需承担相应法律后果。例如，在非法集资案件中，某些员工负责向社会公众宣传推广非法集资项目并吸收资金，这些员工就可能被认定为非法集资的共犯，从而承担刑事责任。
明知违法仍提供协助：
- 即便员工未直接实施核心违法行为，但若在明知公司行为违法的情况下，仍然为其提供协助、支持或隐瞒不报，也可能因协助违法行为而承担法律责任。例如，明知公司非法倾倒有毒废弃物却仍负责运输的员工，就可能因协助违法行为而受到法律追究。
存在过失或疏忽导致违法：
- 员工在履行职责过程中，若因过失或疏忽未能及时发现并纠正公司的违法行为，甚至加剧了违法行为的后果，也可能需要承担一定的法律责任。特别是财务人员、管理人员等关键岗位，因其职责涉及公司合规与风险管理，更需警惕此类风险。例如，公司财务人员因疏忽未能发现公司账目中的虚假记录，导致公司违法行为的持续，该财务人员就可能因过失而承担法律责任。
负有管理责任却失职：
- 对于公司的高级管理人员，如部门经理、总监等，若他们对公司的违法活动负有管理责任，却因疏于监督、管理或默许而导致违法活动发生或持续，也将可能承担法律责任。例如，生产部门经理对产品质量负有管理职责，若其管理的车间生产出不符合安全标准的产品并造成损害，该经理可能会因管理失职而被追究法律责任。
三、员工如何维护自身权益
保持警惕并及时报告：
- 员工应对公司的经营活动保持警惕，一旦发现违法行为，应立即向相关部门或上级报告，以避免自己因不知情而被卷入其中。同时，保留好相关证据，以便在必要时证明自己的清白。
向公司提出申诉：
- 若员工因公司违法行为受到损害，可向公司提出书面申诉，要求赔偿损失，并保留进一步追究法律责任的权利。在申诉过程中，员工应详细陈述事实、提供证据，并明确自己的诉求。
向相关部门举报：
- 员工有权向相关监管部门举报公司的违法行为，以维护自身合法权益及市场秩序。举报时，应确保举报内容真实可靠，并提供必要证据。同时，员工应了解举报的流程和注意事项，以确保举报的有效性。
寻求法律援助：
- 若员工在公司违法行为中受到损害，且无法通过公司内部途径解决争议，可寻求专业律师的法律援助。律师将根据员工的具体情况提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助员工维护自身权益。
总结与建议：公司在违法时，员工的牵连情况需根据具体情况分析。为避免不必要的法律风险，建议员工在公司工作中始终保持警惕，遵守法律法规和公司规章制度，不参与任何违法活动。同时，对于负有管理职责的员工来说，更应加强监管力度，确保公司运营的合法合规性。只有这样，才能有效保护自己和公司的利益不受损害。如果你有任何关于劳动工伤或刑事辩护的法律问题，都可以直接向我咨询。