行政复议后，被申请行政机关在特定情况下仍然能够进行调查处理。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、行政复议的性质与目的
行政复议是公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其合法权益时，依法向有复议权的行政机关提出申请，由受理申请的行政机关对原具体行政行为依法进行审查并作出决定的活动。其目的在于纠正违法的或不当的具体行政行为，保护公民、法人和其他组织的合法权益，保障和监督行政机关依法行使职权。
二、行政复议后被申请行政机关的调查处理权
复议决定未改变原行政行为时：
- 如果行政复议决定维持了原行政行为，那么被申请行政机关在复议后仍然有权对其作出的原行政行为进行后续的调查处理，以确保行政行为的合法性和有效性。例如，在行政处罚案件中，如果复议机关维持了原处罚决定，被申请行政机关（如市场监管部门）在复议后仍需对违法行为的整改情况进行监督。
复议决定改变原行政行为时：
- 如果行政复议决定改变了原行政行为，如撤销、变更或确认违法等，被申请行政机关在复议后通常不再对原行政行为进行调查处理，而是需要执行复议决定。然而，这并不意味着被申请行政机关在所有情况下都完全丧失调查处理权。例如，在复议决定撤销原行政行为并责令重新作出具体行政行为的情况下，被申请行政机关在重新作出行政行为前，可能需要对相关事实进行进一步的调查核实。
复议期间或复议后新发现的事实：
- 在行政复议期间或复议后，如果被申请行政机关新发现了与原行政行为相关的事实或证据，且这些事实或证据可能影响原行政行为的合法性或适当性，那么被申请行政机关在必要时仍然有权进行调查处理。但这种情况下的调查处理应当遵循法定程序，并确保不侵犯复议申请人的合法权益。
三、被申请行政机关调查处理的限制
复议决定的拘束力：
- 行政复议决定对被申请行政机关具有拘束力。一旦复议决定作出并送达，被申请行政机关必须执行复议决定，不得再以同一事实和理由作出与原行政行为相同或基本相同的具体行政行为。
法定程序与期限：
- 被申请行政机关在复议后进行调查处理时，必须遵循法定程序和期限。例如，在重新作出行政行为前，应当给予当事人陈述、申辩的机会；在作出行政处罚决定前，应当依法告知当事人拟作出的行政处罚内容及事实、理由、依据，并告知当事人依法享有的陈述、申辩、要求听证等权利。
四、实际案例与法律适用
在实际操作中，行政复议后被申请行政机关的调查处理权往往与具体案件的事实、法律适用以及复议决定的内容密切相关。例如，在某起行政处罚案件中，复议机关认为原处罚决定证据不足，撤销了原处罚决定并责令重新作出。在此情况下，被申请行政机关在重新作出处罚决定前，需要对相关事实进行进一步的调查核实，以确保新作出的处罚决定具有充分的事实依据和法律依据。
总结与建议：
行政复议后，被申请行政机关在特定情况下仍然能够进行调查处理，但这种调查处理权受到复议决定的拘束力、法定程序与期限等多重限制。如果您在行政复议后遇到被申请行政机关进行调查处理的情况，且对该调查处理的合法性、适当性存在疑问，可以直接向我咨询，我将结合具体案情和法律规定为您提供专业的法律意见。