结论：在此情况下，员工可以起诉个人雇主、转包公司以及政府（视具体情况而定），但最直接且通常有效的起诉对象是个人雇主，同时根据实际情况考虑是否将转包公司列为共同被告。
详细分析：
个人雇主的责任：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，个人雇主与其雇佣的员工之间形成劳动关系（尽管这种关系在形式上可能不如公司与员工之间的劳动关系那么正式，但法律上仍承认其存在）。
- 当员工在从事雇佣活动中遭受工伤时，个人雇主应承担相应的赔偿责任。这包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等。
转包公司的责任：
- 如果转包公司在转包过程中存在过错，如未对个人雇主的资质进行审查、未签订书面转包合同明确双方权利义务等，转包公司可能需要对员工的工伤承担一定的连带责任。
- 特别是在某些情况下，如果转包公司实际上对个人雇主的工作有控制或监督权，或者从个人雇主的工作中获得了直接利益，那么转包公司更有可能被认定为需要承担责任。
政府的责任：
- 政府作为防汛工程的发包方，通常不直接对员工的工伤承担责任，除非政府在发包过程中存在过错，如选择了不具备相应资质的公司进行承包，或者未对承包过程进行必要的监督和管理。
- 在大多数情况下，政府会通过合同条款来明确承包方和转包方的责任，从而避免自身直接承担工伤赔偿责任。
法律建议：
- 收集证据：员工应首先收集与工伤相关的所有证据，包括医疗记录、工作记录、证人证言等，以证明工伤的发生以及与工作活动的关联性。
- 确定起诉对象：根据上述分析，员工可以首先考虑起诉个人雇主。如果认为转包公司或政府也存在过错，可以咨询专业律师（即我，龙邦亮律师，专注于婚姻家庭、劳动纠纷领域）以确定是否将它们列为共同被告。
- 寻求法律援助：由于劳动纠纷可能涉及复杂的法律程序和证据收集，员工可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（再次提醒，可以直接向我咨询）以更好地维护自己的权益。
可能后果：
- 如果员工能够证明工伤的发生以及与工作活动的关联性，并且能够确定责任主体（个人雇主、转包公司或政府），那么员工有可能获得相应的赔偿。
- 如果证据不足或责任主体难以确定，员工可能会面临赔偿困难或无法获得赔偿的风险。因此，及时收集证据和咨询专业律师至关重要。