结论：员工业务暂支款未归还两年以上，企业仍然有权追索，但需注意诉讼时效的问题，并采取合适的追索方式。
分析：
诉讼时效的考量：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，从员工应当归还暂支款而未归还之日起算，企业有三年的时间来通过法律途径追索这笔款项。
- 如果企业在这三年内没有采取任何法律行动，且没有诉讼时效中断或中止的情形，那么超过三年后，企业再向法院提起诉讼，可能会面临被驳回的风险，因为此时诉讼时效已经届满。但值得注意的是，如果企业能够证明在诉讼时效期间内曾向员工主张过权利（如发送催款通知等），则可能构成诉讼时效的中断，诉讼时效将重新计算。
追索方式的选择：
- 内部处理：企业可以先尝试通过内部渠道，如与员工沟通、发送催款通知等方式，要求员工归还暂支款。这种方式相对温和，有助于维护企业与员工之间的关系。
- 法律途径：如果内部处理无效，企业可以考虑通过法律途径追索。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁（如果双方有仲裁协议的话）。在提起诉讼或申请仲裁前，企业应确保收集足够的证据，如暂支款的申请单、审批单、转账记录、催款通知等，以证明员工确实未归还暂支款。
特殊情况的处理：
- 如果员工已经离职，且企业无法联系到员工或员工拒绝归还暂支款，企业可能需要通过法律程序来追索。这可能包括向法院申请支付令或提起诉讼等。
- 如果员工暂支款的行为涉嫌职务侵占或挪用资金等犯罪行为，企业还可以考虑向公安机关报案，通过刑事途径来追索款项并追究员工的刑事责任。
建议：
- 企业应建立健全的财务管理制度，明确暂支款的申请、审批、使用和归还流程，以减少类似纠纷的发生。
- 一旦发现员工未归还暂支款，企业应及时采取措施进行追索，并保留好相关证据，以备不时之需。
- 如果对诉讼时效或追索方式有疑问，建议企业及时咨询专业律师，以确保自身权益得到有效维护。
示例：
假设某员工在2020年1月1日申请了1万元的业务暂支款，并获得了企业的批准。但截至2022年12月31日，该员工仍未归还这笔款项。此时，企业仍然有权在接下来的三年内（即至2025年12月31日前）通过法律途径追索这笔款项。但如果企业在这三年内没有采取任何行动，且没有诉讼时效中断或中止的情形，那么超过2025年12月31日后，企业再向法院提起诉讼可能会面临被驳回的风险。因此，企业应及时采取措施进行追索，并咨询专业律师以确保自身权益得到有效维护。