结论：在职期间仲裁公司但被公司辞退的情况下，仲裁时效的计算主要取决于劳动者知道或应当知道权利被侵害之日，且可能因特定情况而中断或中止。具体来说，仲裁时效通常为一年，但存在中断、中止等特殊情况时，时效期间会重新计算或继续计算剩余时间。
详细分析：
仲裁时效的一般规定：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这一时效期间从劳动者知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。例如，若公司在职期间明确告知了辞退劳动者的具体日期，那么仲裁时效就从该辞退之日起算。
仲裁时效的中断：
- 在仲裁时效期间内，如果劳动者通过协商、申请调解等方式向用人单位主张权利，或者向劳动监察部门等有关部门请求权利救济，又或者用人单位同意履行义务，那么仲裁时效会中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算一年。
- 举例：假设劳动者在职期间因公司违法行为提起仲裁，但在仲裁过程中被公司辞退。若劳动者在辞退后继续向公司主张权利（如要求支付违法辞退赔偿金），则仲裁时效会从主张权利之日起中断，并重新计算一年。
仲裁时效的中止：
- 如果因不可抗力（如自然灾害、战争等）或者有其他正当理由（如重大疾病、被限制人身自由等），导致劳动者不能在一年的仲裁时效期间内申请仲裁，那么仲裁时效会中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算剩余的时间。
- 举例：若劳动者在职期间提起仲裁，但在仲裁过程中遭遇重大疾病无法继续申请仲裁，则仲裁时效会中止。待劳动者恢复健康后，仲裁时效期间继续计算剩余的时间。
特殊情形的说明：
- 值得注意的是，虽然劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制，但本案例中的争议主要围绕辞退和仲裁时效的计算，通常不属于拖欠劳动报酬争议范畴，因此一般仍适用一年的仲裁时效规定。
法律后果与建议：
- 如果劳动者未在仲裁时效期间内申请仲裁，可能会丧失请求劳动争议仲裁机构保护的权利，同时也可能无法再请求人民法院进行司法保护。因此，劳动者在权益受到侵害时，应及时采取行动，确保在规定的时效期间内申请仲裁。
- 建议：劳动者在职期间或被辞退后，应尽快咨询专业律师（即我本人，杜沛均律师，专注于劳动纠纷领域），了解自己的权利和义务，并收集相关证据材料。在仲裁时效期间内，及时向劳动争议仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，在职期间仲裁公司但被公司辞退的情况下，仲裁时效的计算需综合考虑多种因素。劳动者应充分了解并遵循相关法律规定，及时采取行动以维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。