劳动关系的认定主要由劳动争议仲裁委员会和劳动行政部门（通常指人力资源和社会保障部门）负责。以下是对这两个部门在劳动关系认定中的具体角色和职责的详细解释：
一、劳动争议仲裁委员会
主要职责：
- 劳动争议仲裁委员会是专门处理劳动争议的准司法机构，其裁决具有法律效力。
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动争议仲裁委员会负责依法受理和处理包括确认劳动关系在内的劳动人事争议案件。
适用情况：
- 当劳动者与用人单位就劳动关系是否存在产生争议，且无法通过协商解决时，劳动者可向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 特别是在未签订书面劳动合同、工伤认定等需要明确劳动关系的情况下，劳动争议仲裁委员会的裁决具有关键作用。
申请流程：
- 提交申请：劳动者需提交书面仲裁申请及副本，详细载明双方信息、仲裁请求、事实理由及证据等。
- 受理审查：仲裁委员会审查决定是否受理，并通知双方。
- 开庭审理：双方陈述观点、提供证据、质证辩论。
- 作出裁决：基于庭审和证据，仲裁委员会依法作出是否存在劳动关系的裁决。
二、劳动行政部门（人力资源和社会保障部门）
主要职责：
- 劳动行政部门，特别是人力资源和社会保障部门，承担着劳动监察的重要职能。
- 在处理劳动保障监察案件时，劳动行政部门有权依职权对劳动关系进行调查核实。
适用情况：
- 劳动者在遇到劳动关系问题时，可以向劳动行政部门投诉并请求对劳动关系进行认定。
- 特别是在处理工伤认定申请时，如果劳动者与用人单位之间就劳动关系存在争议，劳动行政部门会进行调查核实，以确定双方是否确实存在劳动关系。
处理流程：
- 接受投诉举报：劳动者提供线索和材料，如工资支付记录、工作证等。
- 调查核实：劳动行政部门对用人单位进行调查，要求提供相关材料以核实劳动关系。
- 作出处理决定：若确认劳动关系存在，劳动行政部门将依法对用人单位的违法行为作出处理，如责令支付拖欠工资、补缴社会保险等。
三、建议与指导
- 了解权利与法律途径：劳动者应充分了解自己的权利和法律途径，以便在遇到劳动关系问题时能够及时、有效地维护自己的权益。
- 积极沟通协商：在遇到劳动关系问题时，劳动者可以尝试与用人单位进行沟通协商，寻求和解。
- 及时申请仲裁或投诉：若协商无果，劳动者应及时向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，或者向劳动行政部门投诉求助。
- 准备相关证据：为了更有效地维护自己的权益，劳动者应准备好相关证据材料，如劳动合同、工资发放记录、工作证、考勤记录等，以证明双方存在劳动关系。
综上所述，劳动关系的认定是一个涉及多个部门和法律程序的复杂过程。劳动者应充分了解相关法律规定和操作流程，积极运用法律武器来维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。