您好，关于确定劳动关系的部门，这主要涉及到人力资源和社会保障部及其下属的相关机构，特别是劳动关系司。以下是对此问题的详细解答：
一、主要负责部门
在确定劳动关系方面，人力资源和社会保障部是主要的政府机构，它负责全国的人力资源和社会保障工作，包括劳动关系的协调与管理。而具体到劳动关系的日常管理和政策制定，则主要由其下属的劳动关系司来承担。
二、劳动关系司的主要职责
劳动关系司在确定劳动关系方面扮演着关键角色，其主要职责包括但不限于：
拟订劳动关系工作体系：这包括构建和完善劳动关系的工作框架和制度，以确保劳动关系的和谐稳定。
拟订劳动合同制度和劳动用工规范：劳动合同是确定劳动关系的基础，劳动关系司负责制定和实施相关的劳动合同制度和劳动用工规范，以保障劳动者的权益。
拟订劳动用工备案制度实施规范：通过劳动用工备案制度，可以更好地掌握劳动关系的动态变化，为劳动关系的协调和管理提供依据。
拟订集体合同制度实施规范和集体协商规则：集体合同和集体协商是协调劳动关系的重要手段，劳动关系司负责制定和实施相关的规范和规则。
拟订劳动标准体系：这包括制定企业职工工作时间、休息休假制度等，以保障劳动者的基本权益。
牵头劳动关系综合性工作：劳动关系司还负责牵头处理劳动关系的综合性问题，如劳动争议调解、仲裁等。
三、实际操作中的劳动关系确定
在实际操作中，劳动关系的确定通常依赖于劳动合同的签订。当劳动者与用人单位签订劳动合同后，双方即建立了劳动关系。如果发生劳动争议或纠纷，劳动关系司及其下属机构（如劳动监察局、调解仲裁管理司等）将介入处理，通过调解、仲裁等方式来确定和协调劳动关系。
四、其他相关机构
除了人力资源和社会保障部及其下属机构外，地方人力资源和社会保障局也负责本地区的劳动关系协调与管理工作。它们根据国家和地方的政策法规，结合本地区的实际情况，制定和实施具体的劳动关系管理措施。
综上所述，确定劳动关系的主要部门是人力资源和社会保障部及其下属的劳动关系司，同时地方人力资源和社会保障局也扮演着重要角色。如果您在劳动关系方面遇到任何问题或需要进一步的咨询，建议联系当地的人力资源和社会保障部门或相关机构以获取帮助。