确认劳动关系通常由劳动人事争议仲裁委员会、劳动保障监察机构以及人民法院负责，具体职能和适用情况如下：
一、劳动人事争议仲裁委员会
主要职能：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动人事争议仲裁委员会负责依法受理和处理包括确认劳动关系在内的劳动人事争议案件。其作出的仲裁裁决具有法律效力，是解决劳动关系争议的重要途径。
适用情况：
- 当劳动者与用人单位就劳动关系存在争议，且无法通过协商解决时，劳动者可向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁。
- 特别是在未签订书面劳动合同、工伤认定等需要明确劳动关系的情况下，劳动人事争议仲裁委员会的裁决具有关键作用。
申请流程：
- 提交申请：劳动者需提交书面仲裁申请及副本，详细载明双方信息、仲裁请求、事实理由及证据等。
- 受理审查：仲裁委员会审查决定是否受理，并通知双方。
- 开庭审理：双方陈述观点、提供证据、质证辩论。
- 作出裁决：基于庭审和证据，仲裁委员会依法作出是否存在劳动关系的裁决。
二、劳动保障监察机构
主要职能：
- 劳动保障监察机构负责对用人单位遵守劳动保障法律法规的情况进行监督检查，包括劳动关系的认定。在处理劳动保障监察案件时，可依法调查核实劳动关系。
适用情况：
- 适用于用人单位存在拖欠工资、未缴纳社会保险等违法行为，且这些行为的处理需先明确劳动关系的情况。
- 劳动者可向企业所在地的劳动保障监察机构投诉举报，请求对劳动关系进行认定。
处理流程：
- 接受投诉举报：劳动者提供线索和材料，如工资支付记录、工作证等。
- 调查核实：劳动保障监察机构对用人单位进行调查，要求提供相关材料以核实劳动关系。
- 作出处理决定：若确认劳动关系存在，将依法对用人单位的违法行为作出处理，如责令支付拖欠工资、补缴社会保险等。
三、人民法院
主要职能：
- 如果当事人对劳动争议仲裁委员会的裁决不服，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。人民法院会依据相关法律法规对案件进行全面审查，并作出判决。
适用情况：
- 适用于对劳动争议仲裁委员会裁决不服，需要寻求司法救济的情况。
- 人民法院的判决具有最终法律效力，是解决劳动关系争议的最后途径。
诉讼流程：
- 起诉：对仲裁裁决不服的，向有管辖权的人民法院提起诉讼，递交起诉状及副本。
- 受理：人民法院七日内决定是否立案，并通知当事人。
- 审理：按照法定程序进行开庭审理、法庭调查、法庭辩论等。
- 判决：根据审理查明的事实作出判决，当事人可依法提起上诉。
四、综合建议
选择合适的部门：
- 劳动者应根据自身情况和所在地区的具体规定，选择合适的部门进行申请和处理。例如，在劳动关系争议较为明确且希望快速解决的情况下，可以选择劳动人事争议仲裁委员会；在用人单位存在违法行为且需要行政干预的情况下，可以选择劳动保障监察机构。
准备充分的证据：
- 无论选择哪种途径，劳动者都应准备好相关证据材料，如劳动合同、工资发放记录、工作证、考勤记录等，以证明双方存在劳动关系。证据的充分性和真实性对于案件的胜诉至关重要。
了解法律程序和权益：
- 劳动者应充分了解相关法律法规和申请流程，积极维护自己的合法权益。在处理劳动关系争议时，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
确认劳动关系是一个涉及多个部门和法律程序的过程。劳动者应充分了解相关法律规定和操作流程，积极运用法律武器来维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。