事实劳动关系的认定主要由劳动争议仲裁委员会和劳动行政部门（通常指人力资源和社会保障部门）负责。以下是对这两个认定主体的详细解释，以及认定过程中可能涉及的其他要点：

一、劳动争议仲裁委员会

1. 角色与职责：

   • 当劳动者与用人单位就事实劳动关系是否存在产生争议时，双方均可向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，请求确认劳动关系。
   • 仲裁委员会将依据双方提交的证据材料，包括但不限于工资支付凭证、工作证件、考勤记录等，严格依照相关法律法规进行审查和裁决。

2. 认定流程：

   • 申请：劳动者或用人单位在规定的仲裁时效内（一般为一年）提交书面申请，载明基本信息、仲裁请求及事实理由。
   • 受理：仲裁委员会五日内决定是否受理，并通知申请人。
   • 审理：仲裁委员会对双方提供的证据进行审查和质证，必要时可进行调查取证。
   • 裁决：在查明事实基础上作出裁决，一般应在四十五日内完成，复杂案件可延期十五日。

二、劳动行政部门

1. 角色与职责：

   • 劳动行政部门，特别是人力资源和社会保障部门，承担着劳动监察的重要职能。
   • 劳动者在遇到劳动关系问题时，可以向这些部门投诉并请求对劳动关系进行认定。特别是在处理工伤认定申请时，如果劳动者与用人单位之间就劳动关系存在争议，劳动行政部门有权依职权进行调查核实。

2. 认定流程（以劳动监察为例）：

   • 检查与调查：劳动行政部门进入用人单位检查、查阅材料、询问人员、调查取证，以确定双方是否确实存在劳动关系。
   • 认定与处理：根据调查结果认定事实劳动关系，并依法处理违法行为，如责令用人单位补签劳动合同、支付劳动报酬等。

三、认定依据与所需凭证

在认定事实劳动关系时，应综合考虑以下因素，并通常参照以下凭证：

1. 认定依据：

   • 实际用工事实：劳动者提供劳动，用人单位接受并支付报酬。
   • 管理与监督：劳动者接受用人单位持续性的管理、指挥和监督。
   • 业务组成部分：劳动者提供的劳动是用人单位业务的重要组成部分且持续存在。

2. 所需凭证：

   • 工资支付凭证或记录、社会保险费缴纳记录。
   • 用人单位发放的工作证、服务证等身份证明证件。
   • 劳动者填写的招工招聘登记表、报名表等招用记录。
   • 考勤记录。
   • 其他劳动者的证言。其中，部分凭证如工资支付凭证、招工记录、考勤记录由用人单位负举证责任。

四、法律后果与建议

1. 法律后果：

   • 一旦事实劳动关系被认定，双方即建立正式劳动关系，享有和承担劳动法上的权利和义务。劳动者有权获得劳动报酬、休息休假、社会保险等权益；用人单位则有义务提供符合规定的劳动条件、保障劳动者合法权益等。

2. 建议：

   • 面对事实劳动关系认定的问题，劳动者应充分了解自己的权利和法律途径。首先，可以尝试与用人单位进行沟通协商，寻求和解；若协商无果，则应及时向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，或者向劳动行政部门投诉求助。
   • 在准备证据材料时，劳动者应尽可能收集全面、真实的证据，以支持自己的主张。同时，为了更有效地维护自己的权益，劳动者还可以向我咨询具体的法律建议和帮助。

综上所述，事实劳动关系的认定是一个涉及多个部门和法律程序的复杂过程。劳动者应充分了解相关法律规定和操作流程，积极运用法律武器来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。